RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609232.5

CTCFL-222, Transcript of CCCTC-binding factor like, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 3,668 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTCFL-222	ENST00000609232	SPTBN2	O15020	2390 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TUBB	P07437	444 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ADRB2	P07550	413 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RARB	P10826	455 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ARHGAP25	P42331	645 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ERF	P50548	548 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ARPP19	P56211	112 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FKBP1B	P68106	108 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF200	P98182	395 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF2B	Q00403	316 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PLCB4	Q15147	1175 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	UBA3	Q8TBC4	463 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NUCKS1	Q9H1E3	243 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ASIC3	Q9UHC3	531 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SZT2	Q5T011	3432 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CFH	P08603	1231 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ATP4A	P20648	1035 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EDNRB	P24530	442 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GGCX	P38435	758 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CELF3	Q5SZQ8	465 aa	Known RBP	10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TMEM192	Q8IY95	271 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EMC1	Q8N766	993 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GGT7	Q9UJ14	662 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.5	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RPS6KA5	O75582	802 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NEFH	P12036	1026 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PAF1	Q8N7H5	531 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SLC35G2	Q8TBE7	412 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SELENOS	Q9BQE4	189 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAFB	Q9Y5Q3	323 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	UMODL1	Q5DID0	1318 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	IGSF9B	Q9UPX0	1349 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MYL3	P08590	195 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TUBB2A	Q13885	445 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR142	Q7Z601	462 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	BAP1	Q92560	729 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FAM167A	Q96KS9	214 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CDKN2AIP	Q9NXV6	580 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NR2E1	Q9Y466	385 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CAPN7	Q9Y6W3	813 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232		A0A087WZ62	844 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232		H0YCG3	227 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NOL4	O94818	638 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SERPING1	P05155	500 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	NCKAP1L	P55160	1127 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PLEKHH3	Q7Z736	793 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	USP37	Q86T82	979 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SHCBP1	Q8NEM2	672 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	ASAP3	Q8TDY4	903 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	FDXACB1	Q9BRP7	624 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	RNPEP	Q9H4A4	650 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		10.49	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	DAPK3	O43293	454 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PPP1R37	O75864	691 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PGK1	P00558	417 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MCM3	P25205	808 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MEA1	Q16626	185 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CST9	Q5W186	159 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	CHADL	Q6NUI6	762 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SV2A	Q7L0J3	742 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PSPC1	Q8WXF1	523 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	SEMA4D	Q92854	862 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	PCYT2	Q99447	389 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	GPR20	Q99678	358 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		10.48	□□□□□ -0.73
CTCFL-222	ENST00000609232	MAF1	Q9H063	256 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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