RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590112.5

CELF4-216, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene CELF4, Length 3,236 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF4-216ENST00000590112 CCDC105Q8IYK2 499 aa15.93■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.93■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 IRF6O14896 467 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CLDN3O15551 220 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RGS20O76081 388 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 NQO1P15559 274 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PTGIRP43119 386 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 HMGCS2P54868 508 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 SEZ6Q53EL9 994 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 LPAR1Q92633 364 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 NT5C1BQ96P26 610 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 FAM129AQ9BZQ8 928 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 LYPLA2O95372 231 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RARAP10276 462 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MAPTP10636 758 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ACOT2P49753 483 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MAP3K10Q02779 954 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MTMR3Q13615 1198 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ALCAMQ13740 583 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MTERF2Q49AM1 385 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 FBXL13Q8NEE6 735 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TMEM237Q96Q45 408 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ETNK1Q9HBU6 452 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ATP8B3O60423 1300 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CFHP08603 1231 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 GNAT1P11488 350 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RFX1P22670 979 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 SEL1L2Q5TEA6 688 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RFX8Q6ZV50 586 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MAP4K3Q8IVH8 894 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ATG4AQ8WYN0 398 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ZNF516Q92618 1163 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TMEM143Q96AN5 459 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 SH3GL3Q99963 347 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PIDD1Q9HB75 910 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 GRHL1Q9NZI5 618 aa15.92■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 P4HA2O15460 535 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PHF2O75151 1096 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PDE6CP51160 858 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 FSTL1Q12841 308 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 HOOK3Q86VS8 718 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 VSIG1Q86XK7 387 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PASD1Q8IV76 773 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MTMR14Q8NCE2 650 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 JDP2Q8WYK2 163 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TSC22D3Q99576 134 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 KDM4CQ9H3R0 1056 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 DOCK5Q9H7D0 1870 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 O00370 1275 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 JAK3P52333 1124 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PMS2P54278 862 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 C11orf63Q6NUN7 778 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TAS1R3Q7RTX0 852 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TMEM8AQ9HCN3 771 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 HACL1Q9UJ83 578 aa15.91■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 PPFIA2O75334 1257 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 KRT76Q01546 638 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CYP24A1Q07973 514 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 VSIG10LQ86VR7 867 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 HERPUD2Q9BSE4 406 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 GRIN3BO60391 1043 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 GJB6O95452 261 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 HARSP12081 509 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 GJC1P36383 396 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 RAD23BP54727 409 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 MICALL2Q8IY33 904 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CD101Q93033 1021 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ANAPC7Q9UJX3 599 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 CDR2Q01850 454 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CELF4-216ENST00000590112 TXLNGYQ9BZA5 131 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms