RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 NFS1Q9Y697 457 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RARAP10276 462 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SHC3Q92529 594 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 FNBP1Q96RU3 617 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TMEM165Q9HC07 324 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 INTUQ9ULD6 942 aa16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RASSF9O75901 435 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TNFSF9P41273 254 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ORC1Q13415 861 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MTM1Q13496 603 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TMEM270Q6UE05 265 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LRRC71Q8N4P6 559 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ADAM33Q9BZ11 813 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LMCD1Q9NZU5 365 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 FAM163BP0C2L3 166 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MUTP22033 750 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DSG3P32926 999 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PTENP60484 403 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 OTUD6AQ7L8S5 288 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ERP44Q9BS26 406 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PNMA2Q9UL42 364 aa16.07■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PI4K2BG5E9Z4 385 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CCDC188H7C350 402 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LY6KQ17RY6 165 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 NCAPG2Q86XI2 1143 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GPD1LQ8N335 351 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 REPS2Q8NFH8 660 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V0A1Q93050 837 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CARD9Q9H257 536 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TMBIM4Q9HC24 238 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CHST7Q9NS84 486 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PSAPP07602 524 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TCF4P15884 667 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PIK3CAP42336 1068 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 PEX5P50542 639 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CUL1Q13616 776 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SLC29A2Q14542 456 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 EMC2Q15006 297 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CYB5D1Q6P9G0 228 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 NIPA1Q7RTP0 329 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CCDC50Q8IVM0 306 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 UBL4BQ8N7F7 174 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MLXIPLQ9NP71 852 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HAUS2Q9NVX0 235 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.06■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GRIN3BO60391 1043 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 HLA-DRAP01903 254 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SFNP31947 248 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RHOT2Q8IXI1 618 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 IFT74Q96LB3 600 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 TEX13BQ9BXU2 312 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ANKEF1Q9NU02 776 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 LYPLA2O95372 231 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MAPK4P31152 587 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CDR2Q01850 454 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 K7ERI5 159 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GLRA2P23416 452 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 MYO1EQ12965 1108 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SLC5A9Q2M3M2 681 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SEL1L2Q5TEA6 688 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 KAZNQ674X7 775 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ABHD15Q6UXT9 468 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ACAD9Q9H845 621 aa16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ACSL3O95573 720 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 DUPD1Q68J44 220 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 GADL1Q6ZQY3 521 aa16.04■□□□□ 0.16
CTIF-205ENST00000587860 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms