RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570150.1

PKD1-238, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-238	ENST00000570150	SPDYE4	A6NLX3	237 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	LACTBL1	A8MY62	500 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CLASP2	O75122	1294 aa	Known RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RHOBTB3	O94955	611 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CSPG5	O95196	566 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ADSS	P30520	456 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PPP1R2	P41236	205 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CASP5	P51878	434 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ZBTB6	Q15916	424 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SPATA1	Q5VX52	437 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ADGRD2	Q7Z7M1	963 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ADAMTS19	Q8TE59	1207 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FAM212A	Q96EL1	285 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RBAK	Q9NYW8	714 aa	Predicted RBP	19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	MAFF	Q9ULX9	164 aa		19.51	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	LILRB3	O75022	631 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GLUD1	P00367	558 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FGFR3	P22607	806 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ACOT2	P49753	483 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RIN2	Q8WYP3	895 aa	Predicted RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ZNF560	Q96MR9	790 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	HAPLN2	Q9GZV7	340 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	DSE	Q9UL01	958 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	BACE2	Q9Y5Z0	518 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	MUC3A	Q02505	3323 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TTC28	Q96AY4	2481 aa		19.5	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TNFRSF10A	O00220	468 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PDXK	O00764	312 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PER2	O15055	1255 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CNP	P09543	421 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	MCM4	P33991	863 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TNFSF9	P41273	254 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	UBE2H	P62256	183 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KCNA1	Q09470	495 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	DPYD	Q12882	1025 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KCNC3	Q14003	757 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SEZ6	Q53EL9	994 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		19.49	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	C2CD2L	O14523	706 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KLRC4	O43908	158 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	LTBR	P36941	435 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	KCNQ1	P51787	676 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	AP3M2	P53677	418 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PSMD5	Q16401	504 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	JADE1	Q6IE81	842 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CEP57	Q86XR8	500 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SLC9A9	Q8IVB4	645 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SUSD3	Q96L08	255 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FBXL18	Q96ME1	805 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	HSPBP1	Q9NZL4	362 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	19.48	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TEX28	O15482	410 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	TBX10	O75333	385 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	MTHFR	P42898	656 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CLCN4	P51793	760 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	STIM1	Q13586	685 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GRAMD1C	Q8IYS0	662 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GUF1	Q8N442	669 aa	Known RBP	19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CMAS	Q8NFW8	434 aa	Predicted RBP	19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ANKRD36BP1	Q96IX9	119 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	GBP4	Q96PP9	640 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	FNBP1	Q96RU3	617 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CBWD1	Q9BRT8	395 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	DPP3	Q9NY33	737 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	CLEC1B	Q9P126	229 aa		19.47	■□□□□ 0.71
PKD1-238	ENST00000570150	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		19.47	■□□□□ 0.71

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