RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567642.1

PPP4C-211, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

TSL 2

Gene PPP4C, Length 658 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-211ENST00000567642 CXCL8P10145 99 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 LIG4P49917 911 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 MCL1Q07820 350 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM105Q8N8V8 129 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PHOX2BQ99453 314 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PARVGQ9HBI0 331 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CLIC4Q9Y696 253 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NOTCH4Q99466 2003 aa22.87■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HOXA9P31269 272 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 MCM4P33991 863 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ARPP19P56211 112 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SPAG1Q07617 926 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 UVSSAQ2YD98 709 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SLC44A3Q8N4M1 653 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NXPE3Q969Y0 559 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HAPLN2Q9GZV7 340 aa22.86■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ANK1P16157 1881 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TBCAO75347 108 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CLTAP09496 248 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ELF1P32519 619 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SPECC1Q5M775 1068 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SIX5Q8N196 739 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 KIF12Q96FN5 646 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FAM86C1Q9NVL1 165 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TBX20Q9UMR3 447 aa22.85■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 H0Y858 1186 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 H7C4K7 107 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 STK25O00506 426 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SYN3O14994 580 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TRAK2O60296 914 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 RFX1P22670 979 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TNFSF9P41273 254 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CLCN5P51795 746 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NUBP1P53384 320 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ROR1Q01973 937 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 EPSTI1Q96J88 318 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CDH7Q9ULB5 785 aa22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SYT1P21579 422 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF131P52739 623 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 HTR4Q13639 388 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CWF19L1Q69YN2 538 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 USP49Q70CQ1 688 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 TMEM130Q8N3G9 435 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 FAM212AQ96EL1 285 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 SUSD3Q96L08 255 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CCDC39Q9UFE4 941 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 CA14Q9ULX7 337 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.83■■□□□ 1.25
PPP4C-211ENST00000567642 WDR27A2RRH5 827 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 PRRG1O14668 218 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 SRFP11831 508 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 SCP2P22307 547 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 DDIT3P35638 169 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 RESTQ13127 1097 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 PTPAQ15257 358 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 KYAT1Q16773 422 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 CTXN3Q4LDR2 81 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 SLC8B1Q6J4K2 584 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 RTL10Q7L3V2 364 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 APPL2Q8NEU8 664 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF461Q8TAF7 563 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 ITFG1Q8TB96 612 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 FGF13Q92913 245 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 MSTO1Q9BUK6 570 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 WNT16Q9UBV4 365 aa22.82■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 TTC26A0AVF1 554 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 LACTBL1A8MY62 500 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 ANHXE9PGG2 379 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 OGTO15294 1046 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 LRG1P02750 347 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 POU2F2P09086 479 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 NPR3P17342 541 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 ZNF280DQ6N043 979 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 DDX12PQ92771 950 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 KCNN1Q92952 543 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 BACH2Q9BYV9 841 aa22.81■■□□□ 1.24
PPP4C-211ENST00000567642 CYP4F11Q9HBI6 524 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms