RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	ARID2	Q68CP9	1835 aa		19.63	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TNS1	Q9HBL0	1735 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SLCO1A2	P46721	670 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PRKCE	Q02156	737 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SNX1	Q13596	522 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	XKR3	Q5GH77	459 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF516	Q92618	1163 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	MAF1	Q9H063	256 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	STYXL1	Q9Y6J8	313 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	FER1L6	Q2WGJ9	1857 aa		19.62	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	RASSF9	O75901	435 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRA	P01903	254 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ATF2	P15336	505 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PIK3CA	P42336	1068 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	MNAT1	P51948	309 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	BACE1	P56817	501 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	MIS18BP1	Q6P0N0	1132 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	MON1B	Q7L1V2	547 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TAS1R3	Q7RTX0	852 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	RHOT1	Q8IXI2	618 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	AAAS	Q9NRG9	546 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	RIPK3	Q9Y572	518 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TP73	O15350	636 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TCEA3	O75764	348 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TTC4	O95801	387 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DPEP1	P16444	411 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ACTR2	P61160	394 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ABHD15	Q6UXT9	468 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC113	Q9H0I3	377 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CHST7	Q9NS84	486 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KLC4	Q9NSK0	619 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		19.61	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCT8L1P	A6NM43	557 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SORBS3	O60504	671 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KCNA3	P22001	575 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	IVD	P26440	423 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SCTR	P47872	440 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CNGA2	Q16280	664 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCNG2	Q16589	344 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC89	Q8N998	374 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SCLT1	Q96NL6	688 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DNM1L	O00429	736 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ACSL3	O95573	720 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ADCY8	P40145	1251 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CETN2	P41208	172 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CUL2	Q13617	745 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	EXOC3L1	Q86VI1	746 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	CCDC50	Q8IVM0	306 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KATNAL2	Q8IYT4	538 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	JDP2	Q8WYK2	163 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		19.6	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	RGS20	O76081	388 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PIGR	P01833	764 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	VIM	P08670	466 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ITGA8	P53708	1063 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TDRD10	Q5VZ19	366 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF15	Q66K64	600 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF365	Q70YC5	407 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	REPS2	Q8NFH8	660 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	TRIM7	Q9C029	511 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		19.59	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	GSTA1	P08263	222 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	LMNB2	Q03252	620 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	EMC2	Q15006	297 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	LONRF1	Q17RB8	773 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PARP14	Q460N5	1801 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	EXD1	Q8NHP7	514 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		19.58	■□□□□ 0.73
RRN3-205	ENST00000563559	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	19.58	■□□□□ 0.73

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