RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560962.5

USP3-AS1-208, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene USP3-AS1, Length 1,807 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-208ENST00000560962 EFCAB13Q8IY85 973 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TSC1Q92574 1164 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARID3AQ99856 593 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 AGPAT1Q99943 283 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACP6Q9NPH0 428 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NENFQ9UMX5 172 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANK1P16157 1881 aa19.17■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMCO5BA8MYB1 307 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 BUB1O43683 1085 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 CST3P01034 146 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 GCNT1Q02742 428 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ITGA7Q13683 1181 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOTUMQ6P988 496 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 LACTBL1A8MY62 500 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 M0QZ92 97 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ENC1O14682 589 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLU7O95391 586 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM191BP0C7N4 346 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 KRT5P13647 590 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 GRM5P41594 1212 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC27A1Q6PCB7 646 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC47A2Q86VL8 602 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM81BQ96LP2 452 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPV2Q9Y5S1 764 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 MRFAP1Q9Y605 127 aa19.16■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYH10P35580 1976 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TACC1O75410 805 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAF3Q5VWG9 929 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 PALB2Q86YC2 1186 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 WNT8BQ93098 351 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 GLT1D1Q96MS3 346 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASB7Q9H672 318 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 WBP1LQ9NX94 342 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTPN22Q9Y2R2 807 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NUB1Q9Y5A7 615 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDY2AQ9Y6F7 541 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 UMODL1Q5DID0 1318 aa19.15■□□□□ 0.66
USP3-AS1-208ENST00000560962 NPTXRO95502 500 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CALCAP01258 141 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 TNNC2P02585 160 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 H2AFZP0C0S5 128 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 MYL6P60660 151 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOP14P78316 857 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTGISQ16647 500 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 SLC10A6Q3KNW5 377 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 H2AFVQ71UI9 128 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 LRRN4CLQ8ND94 238 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 SH3TC2Q8TF17 1288 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NFICP08651 508 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNB2P17787 502 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRPC3Q13507 836 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CUL2Q13617 745 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 TMEM130Q8N3G9 435 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ARRDC4Q8NCT1 418 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 TRIM58Q8NG06 486 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 EPS8L1Q8TE68 723 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ACAP3Q96P50 834 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOX5Q96PH1 765 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CARD6Q9BX69 1037 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 TAS2R14Q9NYV8 317 aa19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP19.14■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 GALCP54803 685 aa19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 MGAT3Q09327 533 aa19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 JADE1Q6IE81 842 aa19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 IMPG2Q9BZV3 1241 aa19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 FRMPD3Q5JV73 1810 aa19.13■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CTIFO43310 598 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ASS1P00966 412 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CHRNA1P02708 482 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CYP11B1P15538 503 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 PTK7Q13308 1070 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 FAM228AQ86W67 206 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CD302Q8IX05 232 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 PCDHB18PQ96TA0 734 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 CDC23Q9UJX2 597 aa19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.12■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP19.11■□□□□ 0.65
USP3-AS1-208ENST00000560962 A0A1W2PQY0 241 aa19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.3 ms