RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 HIST1H2ADP20671 130 aa8.53□□□□□ -1.04
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF839A8K0R7 811 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 SNX2O60749 519 aa8.52□□□□□ -1.05
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PTPRB-209ENST00000550857 CHKAP35790 457 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRB-209ENST00000550857 PPP2R5CQ13362 524 aa8.52□□□□□ -1.05
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