RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 LNX2Q8N448 690 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 STON2Q8WXE9 905 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 FBXO34Q9NWN3 711 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TLK1Q9UKI8 766 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 PRKAB1Q9Y478 270 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 GPR45Q9Y5Y3 372 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.65□□□□□ -1.34
GNPTAB-208ENST00000550718 TRIM75PA6NK02 468 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 VAV2P52735 878 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 NHLH1Q02575 133 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ATP2B3Q16720 1220 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 FITM2Q8N6M3 262 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 NLGN4YQ8NFZ3 816 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 NACC2Q96BF6 587 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF31Q96EP0 1072 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PNKPQ96T60 521 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 DUSP26Q9BV47 211 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 DMTF1Q9Y222 760 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.64□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 C1RP00736 705 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 AMY1AP04745 511 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 AGXTP21549 392 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 HSD11B2P80365 405 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 LRCH2Q5VUJ6 765 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 WASHC2AQ641Q2 1341 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PDLIM2Q96JY6 352 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 LDAHQ9H6V9 325 aa6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SALL3Q9BXA9 1300 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PRSS23O95084 383 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 DDCP20711 480 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC6A2P23975 617 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 IL12RB1P42701 662 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 MYOCQ99972 504 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 C7orf25Q9BPX7 421 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CASS4Q9NQ75 786 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXJ2Q9P0K8 574 aa6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PHLDB1Q86UU1 1377 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 OSMP13725 252 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CACNA2D1P54289 1103 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 OR2I1PQ8NGU4 316 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 KCTD5Q9NXV2 234 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 LRIT1Q9P2V4 623 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 USP25Q9UHP3 1055 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC78A2IDD5 438 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PROP1O75360 226 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PLA2G5P39877 138 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CTXN1P60606 82 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 Q8NA96 180 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.6□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 IGLV2-14P01704 120 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CNGA1P29973 690 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 CREMQ03060 361 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA0895LQ68EN5 471 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 SLC17A6Q9P2U8 582 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 DNM3Q9UQ16 869 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 NEU2Q9Y3R4 380 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-208ENST00000550718 A0A1W2PS29 197 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 HAUS5O94927 633 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 LMO1P25800 156 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 PTH2RP49190 550 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 NOMO3P69849 1222 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 SLFN5Q08AF3 891 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 NOMO2Q5JPE7 1267 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 RSAD1Q9HA92 442 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 HSFX1Q9UBD0 423 aa6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC151A5D8V7 595 aa6.57□□□□□ -1.36
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