RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539921.5

SNHG1-211, Transcript of small nucleolar RNA host gene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG1, Length 1,071 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG1-211ENST00000539921 PPARAQ07869 468 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MGAT5Q09328 741 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ARPINQ7Z6K5 226 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SATL1Q86VE3 508 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HEATR4Q86WZ0 1026 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KBTBD2Q8IY47 623 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LINC00469Q8N7U9 141 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PDPRQ8NCN5 879 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TTC8Q8TAM2 541 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MDM1Q8TC05 714 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CHAC2Q8WUX2 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DYDC2Q96IM9 177 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PHACTR3Q96KR7 559 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TTC25Q96NG3 672 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AIFM3Q96NN9 605 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PSKH2Q96QS6 385 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PLVAPQ9BX97 442 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CEP44Q9C0F1 390 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EPB41L4BQ9H329 900 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF287Q9HBT7 754 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CLIC5Q9NZA1 410 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 LRWD1Q9UFC0 647 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MAFFQ9ULX9 164 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CHKBQ9Y259 395 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PIK3C2BO00750 1634 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ALKQ9UM73 1620 aa6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ESYT3A0FGR9 886 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CFAP69A5D8W1 941 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PODXLO00592 558 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 BACH1O14867 736 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF263O14978 683 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 BET1O15155 118 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GSC2O15499 205 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 BUD23O43709 281 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SULT1C4O75897 302 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 KRT36O76013 467 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PKLRP30613 574 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SLC16A2P36021 539 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CETN2P41208 172 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GRIA2P42262 883 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MAGEA1P43355 309 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ALDH3B2P48448 385 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 APLP1P51693 650 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AP3M2P53677 418 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GNG2P59768 71 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PTENP60484 403 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SRP54P61011 504 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 PDK3Q15120 406 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 CYTH1Q15438 398 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 AMHR2Q16671 573 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ZNF568Q3ZCX4 644 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DUPD1Q68J44 220 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TMC7Q7Z402 723 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DHDDSQ86SQ9 333 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HACE1Q8IYU2 909 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 SYCE1Q8N0S2 351 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 GALNT11Q8NCW6 608 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 OR2W6PQ8NHA6 318 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.48□□□□□ -1.37
SNHG1-211ENST00000539921 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms