RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526207.1

TXNRD1-210, Transcript of thioredoxin reductase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TXNRD1, Length 551 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1-210ENST00000526207 ECI2O75521 394 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 C1RP00736 705 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CHRNB1P11230 501 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 AKAP5P24588 427 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CIITAP33076 1130 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LIMK1P53667 647 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 KCNH2Q12809 1159 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 XKR3Q5GH77 459 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TTC22Q5TAA0 569 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LIN9Q5TKA1 542 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 B3GNT9Q6UX72 402 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 Q6ZS52 159 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TMEM143Q96AN5 459 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 MTA3Q9BTC8 594 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 COLEC11Q9BWP8 271 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 KLK14Q9P0G3 267 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 WASF3Q9UPY6 502 aa8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SLC27A2O14975 620 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 GAS7O60861 476 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PSMD10O75832 226 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 KIF4AO95239 1232 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 HOXA9P31269 272 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CXCL12P48061 93 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SOX9P48436 509 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 DNM2P50570 870 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CCR3P51677 355 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 JAK3P52333 1124 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 NRLP54845 237 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 RING1Q06587 406 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PSMD5Q16401 504 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 RTN1Q16799 776 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 STPG1Q5TH74 334 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LRCH2Q5VUJ6 765 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 MIER3Q7Z3K6 550 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CEP57Q86XR8 500 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TMTC2Q8N394 836 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PIK3R5Q8WYR1 880 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM3CQ92520 227 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 DNASE1L2Q92874 299 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TCEAL3Q969E4 200 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TCEAL4Q96EI5 215 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TEKT3Q9BXF9 490 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PIAS3Q9Y6X2 628 aa8.04□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ESYT2A0FGR8 921 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CASTOR2A6NHX0 329 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 hCG_1984214I3L0E3 225 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 EML1O00423 815 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 XYLBO75191 536 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TADA2AO75478 443 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TDP2O95551 362 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 RHOP08100 348 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CCNE1P24864 410 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SFNP31947 248 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 OR1D2P34982 312 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CCR2P41597 374 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CDC42EP1Q00587 391 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 AMHR2Q16671 573 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 FAM78AQ5JUQ0 283 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LRSAM1Q6UWE0 723 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 VITQ6UXI7 678 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LONP2Q86WA8 852 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TEX2Q8IWB9 1127 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 GPR65Q8IYL9 337 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ELSPBP1Q96BH3 223 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ZSWIM3Q96MP5 696 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 RIT2Q99578 217 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 TTPALQ9BTX7 342 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 ZMYND12Q9H0C1 365 aa8.03□□□□□ -1.12
TXNRD1-210ENST00000526207 BRD9Q9H8M2 597 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms