RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519429.1

GSDMB-211, Transcript of gasdermin B, humanhuman

TSL 5

Gene GSDMB, Length 616 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMB-211ENST00000519429 CHAMP1Q96JM3 812 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MEGF10Q96KG7 1140 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CDADC1Q9BWV3 514 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 OBP2AQ9NY56 170 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MSRAQ9UJ68 235 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SPO11Q9Y5K1 396 aa7□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 USP34Q70CQ2 3546 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 A0A0D9SFI3 127 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PI4K2BG5E9Z4 385 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PF4V1P10720 104 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PDE6AP16499 860 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MAPK4P31152 587 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ADD2P35612 726 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CLCN7P51798 805 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TLE2Q04725 743 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SPIRE1Q08AE8 756 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GPR19Q15760 415 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 INF2Q27J81 1249 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 WDR78Q5VTH9 848 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 BROXQ5VW32 411 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CREB3L3Q68CJ9 461 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZFPM1Q8IX07 1006 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SVIPQ8NHG7 77 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 FAM227BQ96M60 508 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 AIFM3Q96NN9 605 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PAGR1Q9BTK6 254 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 FOXP3Q9BZS1 431 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 AP5S1Q9NUS5 200 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MKS1Q9NXB0 559 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CLDND1Q9NY35 253 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MORF4L1Q9UBU8 362 aa6.99□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 VSTM5A8MXK1 200 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GPAA1O43292 621 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 BAG3O95817 575 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 LDHCP07864 332 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 HSPA4P34932 840 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TDO2P48775 406 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TRDNQ13061 729 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SPP2Q13103 211 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 LAPTM5Q13571 262 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SNX17Q15036 470 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TERF2Q15554 542 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GAB4Q2WGN9 574 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SYCP2LQ5T4T6 812 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 HHIPL2Q6UWX4 724 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GPR142Q7Z601 462 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 USP6NLQ92738 828 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CLIP3Q96DZ5 547 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 NAPBQ9H115 298 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PORCNQ9H237 461 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SLC28A3Q9HAS3 691 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 VTA1Q9NP79 307 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 DUSP13Q9UII6 198 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CBLCQ9ULV8 474 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZMYM6O95789 1325 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZNF532Q9HCE3 1301 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.98□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 HIP1RO75146 1068 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 LTFP02788 710 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 GNAT1P11488 350 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 IRF9Q00978 393 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ANKRD1Q15327 319 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 RAB30Q15771 203 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 MBLAC2Q68D91 279 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 EP400NLQ6ZTU2 488 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 Q8N1Y9 231 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 ZNF610Q8N9Z0 462 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 TRPV1Q8NER1 839 aa6.97□□□□□ -1.29
GSDMB-211ENST00000519429 HERVK_113Q902F9 699 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29 ms