RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 MRI1Q9BV20 369 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 VTA1Q9NP79 307 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 LANCL2Q9NS86 450 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 NOX1Q9Y5S8 564 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 PCSK5Q92824 1860 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 RICTORQ6R327 1708 aa6.1□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 IL2RBP14784 551 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ATP5JP18859 108 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 TMPRSS15P98073 1019 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 FOXI1Q12951 378 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 CCDC142Q17RM4 750 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 KCNK18Q7Z418 384 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 STON2Q8WXE9 905 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ORAI2Q96SN7 254 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ZSWIM1Q9BR11 485 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ADI1Q9BV57 179 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 LDAHQ9H6V9 325 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 SCOCQ9UIL1 159 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 ABCA8O94911 1581 aa6.09□□□□□ -1.43
RUFY3-215ENST00000515479 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 CXCR5P32302 372 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 PLA2G5P39877 138 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ALDH1A3P47895 512 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MPP3Q13368 585 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 STAT4Q14765 748 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 NOMO1Q15155 1222 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 RNF31Q96EP0 1072 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 CEP162Q5TB80 1403 aa6.08□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MASP2O00187 686 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 POMCP01189 267 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ELANEP08246 267 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 GUCY1A2P33402 732 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 OCA2Q04671 838 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 PPP3CAQ08209 521 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MALLQ13021 153 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ANO4Q32M45 955 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 RNPEPQ9H4A4 650 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM140Q9NV12 185 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 DNAJC28Q9NX36 388 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 USP35Q9P2H5 1018 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 INSL6Q9Y581 213 aa6.07□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1B0GTW7 788 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 TLDC2A0PJX2 215 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ENDOD1O94919 500 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ESRRBO95718 433 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 OSMP13725 252 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 CPEP16870 476 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FPR1P21462 350 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FDXRP22570 491 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 HSD3B2P26439 372 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FAPQ12884 760 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 PRR16Q569H4 304 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF529Q6P280 563 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 SYCE2Q6PIF2 218 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 GPR149Q86SP6 731 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FHOD3Q2V2M9 1422 aa6.06□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 FGFR4P22455 802 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MCAMP43121 646 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 MASP1P48740 699 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 SLC5A3P53794 718 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 CXADRP78310 365 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 SCAPQ12770 1279 aa6.05□□□□□ -1.44
RUFY3-215ENST00000515479 UBXN2BQ14CS0 331 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms