RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CKB	P12277	381 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EIF4B	P23588	611 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NOS3	P29474	1203 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CRK	P46108	304 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NOV	P48745	357 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SULT1E1	P49888	294 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MPP1	Q00013	466 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4A11	Q02928	519 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MAP7	Q14244	749 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	R3HDM1	Q15032	1099 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	AOC3	Q16853	763 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MINDY4	Q4G0A6	757 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SPOCD1	Q6ZMY3	1216 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CHST3	Q7LGC8	479 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC6	Q86TZ1	520 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKMY2	Q8IV38	441 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC170	Q8IYT3	715 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RASGRP4	Q8TDF6	673 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FBF1	Q8TES7	1133 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LZIC	Q8WZA0	190 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FATE1	Q969F0	183 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SMARCE1	Q969G3	411 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MFSD3	Q96ES6	412 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAXDC2	Q96IV6	333 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ARL5B	Q96KC2	179 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MTMR9	Q96QG7	549 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	RMDN3	Q96TC7	470 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	APOL5	Q9BWW9	433 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IDI2	Q9BXS1	227 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EHD4	Q9H223	541 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ACAD9	Q9H845	621 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TRPV4	Q9HBA0	871 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	LMCD1	Q9NZU5	365 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PHTF1	Q9UMS5	762 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC12A7	Q9Y666	1083 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	STK36	Q9NRP7	1315 aa		7.26	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SERTM1	A2A2V5	107 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	YDJC	A8MPS7	323 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		B4DLN1	442 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971		H0Y626	953 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	UBXN8	O00124	270 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NCAM2	O15394	837 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	TLR5	O60602	858 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ENTPD3	O75355	529 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KATNA1	O75449	491 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NEBL	O76041	1014 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	DDAH1	O94760	285 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	EPN2	O95208	641 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP11A1	P05108	521 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IDO1	P14902	403 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF3	P17036	446 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	IFNAR1	P17181	557 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SEPHS1	P49903	392 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	METAP2	P50579	478 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CAP1	Q01518	475 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	GABPA	Q06546	454 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SQSTM1	Q13501	440 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	SEPT6	Q14141	434 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NTRK3	Q16288	839 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	ECM1	Q16610	540 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	C4orf17	Q53FE4	359 aa		7.25	□□□□□ -1.25
FBXO38-208	ENST00000504971	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25

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