RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502974.1

CXCL3-202, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

TSL 2

Gene CXCL3, Length 630 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-202ENST00000502974 SUSD6Q92537 303 aa27.18■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 KIF12Q96FN5 646 aa27.18■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 C19orf67A6NJJ6 358 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 LACTBL1A8MY62 500 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 B3GAT3O94766 335 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 EHHADHQ08426 723 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 KIAA0319Q5VV43 1072 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CHST7Q9NS84 486 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ANK1P16157 1881 aa27.17■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 PODXLO00592 558 aa27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CLCN4P51793 760 aa27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ITIH3Q06033 890 aa27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP27.16■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 TEX28O15482 410 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 KLRC4O43908 158 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF202O95125 648 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 GARTP22102 1010 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CREMQ03060 361 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 FAM171A1Q5VUB5 890 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 C3orf58Q8NDZ4 430 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 SAAL1Q96ER3 474 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 FBXL18Q96ME1 805 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ADAM7Q9H2U9 754 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 SLC39A2Q9NP94 309 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 EXOC1Q9NV70 894 aa27.15■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 VWA8A3KMH1 1905 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 RPL9P32969 192 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ARMCX5Q6P1M9 558 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CD300LGQ6UXG3 332 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 KRBA2Q6ZNG9 492 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CEP57Q86XR8 500 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CD302Q8IX05 232 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 GPR65Q8IYL9 337 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 ZNF507Q8TCN5 953 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 CBWD1Q9BRT8 395 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 FAM213AQ9BRX8 229 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 SFXN1Q9H9B4 322 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 RXFP1Q9HBX9 757 aa27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
CXCL3-202ENST00000502974 PLXNA3P51805 1871 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GLUD1P00367 558 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 MYL1P05976 194 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ADRB2P07550 413 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PRR29P0C7W0 189 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 HOXD13P35453 343 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 KMT5BQ4FZB7 885 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RTP2Q5QGT7 225 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 JADE1Q6IE81 842 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 NELFCDQ8IXH7 590 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM130Q8N3G9 435 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RIPOR3Q96MK2 946 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 NECTIN4Q96NY8 510 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TTPALQ9BTX7 342 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PCIF1Q9H4Z3 704 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 CHMP5Q9NZZ3 219 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 UBE4BO95155 1302 aa27.13■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 XPOTO43592 962 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 BRCC3P46736 316 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ZBTB6Q15916 424 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 SCFD1Q8WVM8 642 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 EPHX3Q9H6B9 360 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 FNIP2Q9P278 1114 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 DPP7Q9UHL4 492 aa27.12■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GOLGA8IPA6NC78 632 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GOLGA8JA6NMD2 632 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 I3L4J1 428 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TRAPPC3O43617 180 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 LDHAP00338 332 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 RPN1P04843 607 aaKnown RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 NFICP08651 508 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 MTHFRP42898 656 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GUCY2FP51841 1108 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TMEM132DQ14C87 1099 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 GLYCTKQ8IVS8 523 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 TSPAN18Q96SJ8 248 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 ASB7Q9H672 318 aa27.11■■□□□ 1.93
CXCL3-202ENST00000502974 MAN1C1Q9NR34 630 aa27.11■■□□□ 1.93
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