RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498268.1

USP34-222, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 3

Gene USP34, Length 497 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-222	ENST00000498268	FOXF2	Q12947	444 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	LANCL2	Q9NS86	450 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	C1R	P00736	705 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	VAV2	P52735	878 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	NHLH1	Q02575	133 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	GEN1	Q17RS7	908 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	CCHCR1	Q8TD31	782 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
USP34-222	ENST00000498268	OSM	P13725	252 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SLFN5	Q08AF3	891 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MALL	Q13021	153 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	LNX2	Q8N448	690 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DPF2	Q92785	391 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	NELL1	Q92832	810 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ASB6	Q9NWX5	421 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TBX22	Q9Y458	520 aa		5.08	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MYADML2	A6NDP7	307 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	EYA4	O95677	639 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SLC6A4	P31645	630 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MTNR1B	P49286	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ATP8B2	P98198	1209 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MTM1	Q13496	603 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	STAT4	Q14765	748 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ANO4	Q32M45	955 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SSH3	Q8TE77	659 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CASKIN2	Q8WXE0	1202 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ADI1	Q9BV57	179 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	WDR26	Q9H7D7	661 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		5.07	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CGB1	A6NKQ9	187 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ELFN1	P0C7U0	828 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CDK4	P11802	303 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	FCER1A	P12319	257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MTHFD2	P13995	350 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	PROK1	P58294	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MGAT2	Q10469	447 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	FAM180A	Q6UWF9	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	FITM2	Q8N6M3	262 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ANKS1A	Q92625	1134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TMEM140	Q9NV12	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	GPR32	O75388	356 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ERN1	O75460	977 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	PRKD3	O94806	890 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ENDOD1	O94919	500 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DDC	P20711	480 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	GATA3	P23771	443 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ABCG1	P45844	678 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	RAB24	Q969Q5	203 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	PNKP	Q96T60	521 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	DNM3	Q9UQ16	869 aa		5.05	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SBK3	P0C264	359 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	FOLR3	P41439	243 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	MASP1	P48740	699 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	COG1	Q8WTW3	980 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	TLR10	Q9BXR5	811 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	RNF7	Q9UBF6	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	WIPF3	A6NGB9	483 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	BRINP1	O60477	761 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	VWA1	Q6PCB0	445 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.03	□□□□□ -1.6
USP34-222	ENST00000498268	SLC30A5	Q8TAD4	765 aa		5.03	□□□□□ -1.6

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