RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498219.5

HPS1-214, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 845 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-214ENST00000498219 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 SLC22A17Q8WUG5 538 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 POMGNT1Q8WZA1 660 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 SAAL1Q96ER3 474 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 TIGD1Q96MW7 591 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 CHST7Q9NS84 486 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 CDH22Q9UJ99 828 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 EXOC7Q9UPT5 735 aa16.02■□□□□ 0.16
HPS1-214ENST00000498219 STYXL1Q9Y6J8 313 aa16.02■□□□□ 0.16
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HPS1-214ENST00000498219 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PODXLO00592 558 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 KINO60870 393 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 HOXD13P35453 343 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 DSG1Q02413 1049 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PPP2R3AQ06190 1150 aa16.01■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 SYCE2Q6PIF2 218 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 CBWD1Q9BRT8 395 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.01■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 SLC38A7Q9NVC3 462 aa16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 BDP1A6H8Y1 2624 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 TEX28O15482 410 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 MYL1P05976 194 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SPATA31D3P0C874 917 aa16■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 JADE1Q6IE81 842 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SLFN12LQ6IEE8 588 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 TMEM184AQ6ZMB5 413 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PALB2Q86YC2 1186 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 NELFCDQ8IXH7 590 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SMRP1Q8NCR6 262 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SCFD1Q8WVM8 642 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 CASP10Q92851 521 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 FAM213AQ9BRX8 229 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 TTPALQ9BTX7 342 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 STK39Q9UEW8 545 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 C2orf16Q68DN1 1984 aa16■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PPEF2O14830 753 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 WEE2P0C1S8 567 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 WNT7BP56706 349 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 ALCAMQ13740 583 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 CAMK4Q16566 473 aa15.99■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 FAM84AQ96KN4 292 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 S1PR5Q9H228 398 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 TMEM206Q9H813 350 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 RXFP1Q9HBX9 757 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 CD320Q9NPF0 282 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa15.99■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 FSD2A1L4K1 749 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 ADAM12O43184 909 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 RHOBTB3O94955 611 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 ADRB2P07550 413 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 ZBTB6Q15916 424 aa15.98■□□□□ 0.15
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HPS1-214ENST00000498219 ISM2Q6H9L7 571 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 GPT2Q8TD30 523 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 FBXL18Q96ME1 805 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa15.98■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 C5orf42Q9H799 3197 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 DOCK6Q96HP0 2047 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 ADH1AP07327 375 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 GARTP22102 1010 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 FGFR3P22607 806 aa15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 RPL9P32969 192 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
HPS1-214ENST00000498219 MCM4P33991 863 aa15.97■□□□□ 0.15
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