RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495787.1

ECHDC3-204, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ECHDC3, Length 505 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-204ENST00000495787 M0QZ92 97 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 AKR1B10O60218 316 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 B4GALT4O60513 344 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 LRRN2O75325 713 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HLA-DRAP01903 254 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CLTBP09497 229 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 STAG3L1P0CL83 205 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 RAG1P15918 1043 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FGFR4P22455 802 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 KIF11P52732 1056 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 MFAP3P55082 362 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 BIRC3Q13489 604 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 SPA17Q15506 151 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM47CQ5HY64 1035 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 WDR44Q5JSH3 913 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 NOTUMQ6P988 496 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF662Q6ZS27 426 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 SERINC5Q86VE9 423 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM212AQ96EL1 285 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GPR88Q9GZN0 384 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ASB7Q9H672 318 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PHF24Q9UPV7 400 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GINS2Q9Y248 185 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TRPV2Q9Y5S1 764 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PTPRJQ12913 1337 aa11.57□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA0355O15063 1070 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PHACTR2O75167 634 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GFPT2O94808 682 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 VNN1O95497 513 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 DNAJB2P25686 324 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ITGB8P26012 769 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GRM5P41594 1212 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PIK3CAP42336 1068 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ACLYP53396 1101 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 EPHB4P54760 987 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 OSTNP61366 133 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GCNT1Q02742 428 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ARID5AQ03989 594 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FPGSQ05932 587 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ITGA7Q13683 1181 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 SLC27A1Q6PCB7 646 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CD302Q8IX05 232 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PPM1KQ8N3J5 372 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TXLNBQ8N3L3 684 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CEP120Q8N960 986 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HELQQ8TDG4 1101 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ACAP3Q96P50 834 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF576Q9H609 170 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 HAUS4Q9H6D7 363 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 C1orf112Q9NSG2 853 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GRIN2DO15399 1336 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 MROH7Q68CQ1 1323 aa11.56□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 LACTBL1A8MY62 500 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF263O14978 683 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 NPTXRO95502 500 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TNNC2P02585 160 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CXCL8P10145 99 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 VAV2P52735 878 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PTGISQ16647 500 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 SMYD5Q6GMV2 418 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 KIAA1328Q86T90 577 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 VPS36Q86VN1 386 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 NT5DC4Q86YG4 428 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 GPIHBP1Q8IV16 184 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 EFCAB13Q8IY85 973 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM192Q8IY95 271 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TMEM40Q8WWA1 233 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 SHC3Q92529 594 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TATDN2Q93075 761 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TIFAQ96CG3 184 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 FAM84AQ96KN4 292 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 KREMEN1Q96MU8 473 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 CDY2AQ9Y6F7 541 aa11.55□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TRIP11Q15643 1979 aa11.54□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
ECHDC3-204ENST00000495787 PLA2G5P39877 138 aa11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms