RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 LRRN2O75325 713 aa23.76■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 GSDMDP57764 484 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 FIGNQ5HY92 759 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 PI4K2AQ9BTU6 479 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ANK1P16157 1881 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ITGB3P05106 788 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 THP07101 528 aa23.76■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 GUCY2FP51841 1108 aa23.76■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.76■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa23.75■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 SIX2Q9NPC8 291 aa23.75■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.75■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 CEP72Q9P209 647 aa23.75■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ITGA11Q9UKX5 1188 aa23.75■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 TET1Q8NFU7 2136 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 PTGESO14684 152 aa23.74■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 GJB7Q6PEY0 223 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 GLB1LQ6UWU2 654 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 CNGA4Q8IV77 575 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 PPM1KQ8N3J5 372 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 DPF3Q92784 378 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ELMO3Q96BJ8 720 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 GANQ9H2C0 597 aa23.74■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 AGAP1Q9UPQ3 857 aa23.74■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PQJ5 194 aa23.73■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.73■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 ZNF699Q32M78 642 aa23.73■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 BADQ92934 168 aa23.73■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 MIOSQ9NXC5 875 aa23.73■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 SIX4Q9UIU6 781 aa23.73■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.73■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.72■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.72■■□□□ 1.39
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PSPC1-204ENST00000492741 URGCPQ8TCY9 931 aa23.72■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 TATDN2Q93075 761 aa23.72■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 IL23AQ9NPF7 189 aa23.72■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 SYN1P17600 705 aa23.71■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 CYP3A5P20815 502 aa23.71■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ARID5BQ14865 1188 aa23.71■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 ARHGAP44Q17R89 818 aa23.71■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 IQCEQ6IPM2 695 aa23.71■■□□□ 1.39
PSPC1-204ENST00000492741 TNS4Q8IZW8 715 aa23.71■■□□□ 1.39
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