RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491660.1

SERP1-208, Transcript of stress associated endoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SERP1, Length 830 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERP1-208ENST00000491660 SPATA1Q5VX52 437 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 SLC9A9Q8IVB4 645 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 C3orf58Q8NDZ4 430 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 AUTS2Q8WXX7 1259 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 GPR62Q9BZJ7 368 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 ZBP1Q9H171 429 aa22.96■■□□□ 1.27
SERP1-208ENST00000491660 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP22.96■■□□□ 1.273e-6■■■■■ 137.9
SERP1-208ENST00000491660 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MBD3O95983 291 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 SOD2P04179 222 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NR2F2P24468 414 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 LRPAP1P30533 357 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CYP24A1Q07973 514 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ZCWPW2Q504Y3 356 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CEP135Q66GS9 1140 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CD300LGQ6UXG3 332 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TRIML1Q8N9V2 468 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 FAM84AQ96KN4 292 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 B3GALT6Q96L58 329 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 STK39Q9UEW8 545 aa22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 HIDE1A8MVS5 230 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PSMA7O14818 248 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CXCL14O95715 111 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 EFEMP2O95967 443 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CTSAP10619 480 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 BRCC3P46736 316 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CASP4P49662 377 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MYBPC2Q14324 1141 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 SURF1Q15526 300 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NT5DC4Q86YG4 428 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TMEM174Q8WUU8 243 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CCDC127Q96BQ5 260 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TSG101Q99816 390 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 DPP3Q9NY33 737 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.94■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 I3L4J1 428 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 C2CD2LO14523 706 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PPEF2O14830 753 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 URODP06132 367 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 DLATP10515 647 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 RPL13P26373 211 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PPP1R2P41236 205 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PMS1P54277 932 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PSMD6Q15008 389 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NFIL3Q16649 462 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 EDRF1Q3B7T1 1238 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 FAM171A1Q5VUB5 890 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ANKRD40Q6AI12 368 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CENPPQ6IPU0 288 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 KIAA1841Q6NSI8 718 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MFSD14AQ96MC6 490 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MYO7AQ13402 2215 aa22.93■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PTPRJQ12913 1337 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TRIM49BA6NDI0 452 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 C2orf71A6NGG8 1288 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TMEM191BP0C7N4 346 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 GLUD2P49448 558 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 ADAM9Q13443 819 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PTPN14Q15678 1187 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 USP41Q3LFD5 358 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CEP57Q86XR8 500 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PPP2R3CQ969Q6 453 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 FNBP1Q96RU3 617 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MTMR12Q9C0I1 747 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 IGFLR1Q9H665 355 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TLE6Q9H808 572 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CTNND2Q9UQB3 1225 aa22.92■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 PER2O15055 1255 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 TRAPPC3O43617 180 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 CCNE1P24864 410 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NRIP1P48552 1158 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 HYAL1Q12794 435 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 OR5B17Q8NGF7 314 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 NELFBQ8WX92 580 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 EEF2KMTQ96G04 330 aa22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SERP1-208ENST00000491660 INTS13Q9NVM9 706 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms