RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 ERVK-21P61565 698 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 NOMO3P69849 1222 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 MTM1Q13496 603 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 CYP2A13Q16696 494 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 NOMO2Q5JPE7 1267 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 LRFN3Q9BTN0 628 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 CASS4Q9NQ75 786 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 HSFX1Q9UBD0 423 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 TLK1Q9UKI8 766 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 DNM3Q9UQ16 869 aa5.98□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 CKBP12277 381 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 SLC5A3P53794 718 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 ATP8B2P98198 1209 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 FAM43AQ8N2R8 423 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 SLC9A6Q92581 669 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 DPF2Q92785 391 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 USP35Q9P2H5 1018 aa5.97□□□□□ -1.45
SSB-211ENST00000490914 CDHR4A6H8M9 788 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 VAV2P52735 878 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SLFN5Q08AF3 891 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FAPQ12884 760 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 GEN1Q17RS7 908 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 WDR66Q8TBY9 1149 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CAGE1Q8TC20 777 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 DUSP26Q9BV47 211 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 KIAA1586Q9HCI6 787 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.96□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FAM171A2A8MVW0 826 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TEX33O43247 280 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 VIL1P09327 827 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 DDCP20711 480 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 AGXTP21549 392 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CNGA1P29973 690 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 RARRES1P49788 294 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FOXR2Q6PJQ5 311 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 KRT26Q7Z3Y9 468 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FITM2Q8N6M3 262 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 RAB24Q969Q5 203 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CYFIP2Q96F07 1278 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 AIFM2Q9BRQ8 373 aa5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ERN1O75460 977 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 C1QL1O75973 258 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 IGLV2-14P01704 120 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SLC6A4P31645 630 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ARHGEF25Q86VW2 580 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 Q8NA96 180 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 NUP133Q8WUM0 1156 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 NRG4Q8WWG1 115 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 KCTD5Q9NXV2 234 aa5.94□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MATN4O95460 622 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 FCER1AP12319 257 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ALAS1P13196 640 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CPEP16870 476 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 PPM1NQ8N819 430 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TBC1D15Q8TC07 691 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SSH3Q8TE77 659 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 PDLIM2Q96JY6 352 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 PNKPQ96T60 521 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MANSC1Q9H8J5 431 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 LRIT1Q9P2V4 623 aa5.93□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 MYADML2A6NDP7 307 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 K7ESF4 209 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 RHOT1Q8IXI2 618 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 LNX2Q8N448 690 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 NELL1Q92832 810 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 C7orf25Q9BPX7 421 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TLR10Q9BXR5 811 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 SEMA4GQ9NTN9 838 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 INTUQ9ULD6 942 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 WASHC2AQ641Q2 1341 aa5.92□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 LRRC3CA6NJW4 275 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 C1RP00736 705 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 CACNA2D1P54289 1103 aa5.91□□□□□ -1.46
SSB-211ENST00000490914 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP5.91□□□□□ -1.46
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