RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SKOR1P84550 965 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD2Q14681 263 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFIL3Q16649 462 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DPY19L2Q6NUT2 758 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KDM7AQ6ZMT4 941 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC25Q86WR0 208 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCTD17Q8N5Z5 321 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDM1Q8TC05 714 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HELQQ8TDG4 1101 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDHR1Q96JP9 859 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYT11Q9BT88 431 aa16.59■□□□□ 0.25
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAFGO15525 162 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TXNP10599 105 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDH1P40925 334 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CHADLQ6NUI6 762 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM192Q8IY95 271 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNPEPQ9H4A4 650 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GJC1P36383 396 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLCO1A2P46721 670 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MOGSQ13724 837 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MREGQ8N565 214 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMO2Q99518 471 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.58■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANKRD62A6NC57 917 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPOPO43791 374 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0754O94854 1291 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SHBGP04278 402 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FMO1Q01740 532 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPATQ06203 517 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM62Q0P6H9 643 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NBPF20Q3BBV1 942 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMC3Q7Z5M5 1100 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CABS1Q96KC9 395 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NT5C1BQ96P26 610 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM118BQ9BPY3 351 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SENP7Q9BQF6 1050 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC113Q9H0I3 377 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AZI2Q9H6S1 392 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NFASCO94856 1347 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HLA-DRAP01903 254 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CYP11B1P15538 503 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COMTP21964 271 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PIK3CAP42336 1068 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT88Q13099 833 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTGISQ16647 500 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 XRRA1Q6P2D8 792 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC10A4Q96EP9 437 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.57■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CST3P01034 146 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FGFR4P22455 802 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GPAT2Q6NUI2 795 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NLRP14Q86W24 1093 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SAMD3Q8N6K7 520 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNERQ8NFT8 737 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SNX1Q13596 522 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF22Q14807 665 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF653Q96CK0 615 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IWS1Q96ST2 819 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPN3Q9H201 632 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM8AQ9HCN3 771 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 H0YGN5 161 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 O00370 1275 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CES2O00748 559 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VNN1O95497 513 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PEX19P40855 299 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INHBEP58166 350 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM270Q6UE05 265 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEPT1Q8WYJ6 367 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENOSQ9BQE4 189 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 INTUQ9ULD6 942 aa16.56■□□□□ 0.24
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms