RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 PARVAQ9NVD7 372 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SNTG2Q9NY99 539 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA11Q9UKX5 1188 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 GYPCP04921 128 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PDGFRBP09619 1106 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ITGA7Q13683 1181 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 PSMD6Q15008 389 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf50Q6ZRC1 276 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 BBS5Q8N3I7 341 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SH3TC2Q8TF17 1288 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 RFFLQ8WZ73 363 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 C18orf8Q96DM3 657 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 EHD2Q9NZN4 543 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1257Q9ULG3 409 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 H7C0C1 242 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 INHAP05111 366 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 COBLL1Q53SF7 1204 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 Q9Y3F1 56 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 MAPK13O15264 365 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 ACADSBP45954 432 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 YME1L1Q96TA2 773 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 FTHL17Q9BXU8 183 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 RSAD1Q9HA92 442 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 PALMO75781 387 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRD-211ENST00000486161 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 UVRAGQ9P2Y5 699 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 ANKRD63C9JTQ0 380 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 MCF2LO15068 1137 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-211ENST00000486161 KRT7P08729 469 aa8.79□□□□□ -1
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