RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478887.1

SFI1-222, Transcript of SFI1 centrin binding protein, human

TSL 4

Gene SFI1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFI1-222	ENST00000478887	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	ZNF233	A6NK53	670 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	HIDE1	A8MVS5	230 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	LILRB3	O75022	631 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	TADA2A	O75478	443 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	B3GAT3	O94766	335 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	NR3C1	P04150	777 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	UROD	P06132	367 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	BMP6	P22004	513 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	PRCP	P42785	496 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	DSG1	Q02413	1049 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	HYAL1	Q12794	435 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	PSMD6	Q15008	389 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	TMC7	Q7Z402	723 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	ADSSL1	Q8N142	457 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	TRIML1	Q8N9V2	468 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	HASPIN	Q8TF76	798 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	FAM212A	Q96EL1	285 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SFI1-222	ENST00000478887	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	FSD2	A1L4K1	749 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MAPK13	O15264	365 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	EXOC3	O60645	756 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	FGFR3	P22607	806 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PPP1R2	P41236	205 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GLUD2	P49448	558 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CYP24A1	Q07973	514 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SURF1	Q15526	300 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CAMK4	Q16566	473 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DUSP6	Q16828	381 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CTC1	Q2NKJ3	1217 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	USP41	Q3LFD5	358 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RTP2	Q5QGT7	225 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KIAA0319	Q5VV43	1072 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CENPP	Q6IPU0	288 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TAS1R1	Q7RTX1	841 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	WDR49	Q8IV35	697 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM130	Q8N3G9	435 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GPT2	Q8TD30	523 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CGRRF1	Q99675	332 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CIT	O14578	2027 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PTPRJ	Q12913	1337 aa		10.27	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PIR	O00625	290 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PSMA7	O14818	248 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PPEF2	O14830	753 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TRAPPC3	O43617	180 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NCK2	O43639	380 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CXCL14	O95715	111 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MBD3	O95983	291 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CD44	P16070	742 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PAX3	P23760	479 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NR2F2	P24468	414 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	BRCC3	P46736	316 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	NRIP1	P48552	1158 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CASP4	P49662	377 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TFAM	Q00059	246 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	LRRC63	Q05C16	580 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	STIM1	Q13586	685 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	KCNC3	Q14003	757 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	FOXR2	Q6PJQ5	311 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	EFHB	Q8N7U6	833 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	RDH13	Q8NBN7	331 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CXorf38	Q8TB03	319 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PPM1E	Q8WY54	764 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	PABPC5	Q96DU9	382 aa	Known RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	SUSD3	Q96L08	255 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	B3GALT6	Q96L58	329 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SFI1-222	ENST00000478887	TLE6	Q9H808	572 aa		10.26	□□□□□ -0.77

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