RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCP2	P22307	547 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	FGFR3	P22607	806 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZBTB6	Q15916	424 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMD5	Q16401	504 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	USP41	Q3LFD5	358 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP57	Q86XR8	500 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA0895	Q8NCT3	520 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	LNX1	Q8TBB1	728 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIK3R5	Q8WYR1	880 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	CASP10	Q92851	521 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	UROC1	Q96N76	676 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	MAN1C1	Q9NR34	630 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	DOCK8	Q8NF50	2099 aa		12.1	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQ27	194 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQ64	194 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A1W2PQD8	194 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	FSD2	A1L4K1	749 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA31D3	P0C874	917 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SP100	P23497	879 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	KLRC2	P26717	231 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	NUCB2	P80303	420 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALCAM	Q13740	583 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	KIAA1841	Q6NSI8	718 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCLRE1A	Q6PJP8	1040 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA31D4	Q6ZUB0	917 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRSK2	Q8IWQ3	736 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	CEP57L1	Q8IYX8	460 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SCFD1	Q8WVM8	642 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	FBXL18	Q96ME1	805 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLSTN3	Q9BQT9	956 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	EMILIN2	Q9BXX0	1053 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOTCH4	Q99466	2003 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	NCOR1	O75376	2440 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	PTPRJ	Q12913	1337 aa		12.09	□□□□□ -0.47
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF10A	O00220	468 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGFB1I1	O43294	461 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TGM5	O43548	720 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	RFPL2	O75678	378 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLUD1	P00367	558 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADH1A	P07327	375 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRPAP1	P30533	357 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABCD1	P33897	745 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYK	P43405	635 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	AMPD3	Q01432	767 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK4	Q13043	487 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PUS10	Q3MIT2	529 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARMCX5	Q6P1M9	558 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMC5	Q6UXY8	1006 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PALB2	Q86YC2	1186 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ADHFE1	Q8IWW8	467 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM213A	Q9BRX8	229 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	MTRR	Q9UBK8	725 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	STK39	Q9UEW8	545 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	UBE4B	O95155	1302 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	C19orf67	A6NJJ6	358 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPTLC1	O15269	473 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	GART	P22102	1010 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	MCM4	P33991	863 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPYD	Q12882	1025 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ELAVL2	Q12926	359 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBX2	Q14781	532 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KYAT1	Q16773	422 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA1	Q5VX52	437 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBWD2	Q8IUF1	395 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	AGPAT3	Q9NRZ7	376 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GTPBP1-208	ENST00000475959	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		12.07	□□□□□ -0.48

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