RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 BHMT2Q9H2M3 363 aa6.07□□□□□ -1.44
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PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF365Q70YC5 407 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 SVIPQ8NHG7 77 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 IL31RAQ8NI17 732 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 BDH2Q9BUT1 245 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 RSAD1Q9HA92 442 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-208ENST00000472760 KIAA1586Q9HCI6 787 aa6.03□□□□□ -1.44
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