RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472398.5

TTC3-214, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 1 (best)

Gene TTC3, Length 2,305 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-214	ENST00000472398	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	KRT84	Q9NSB2	600 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DECR2	Q9NUI1	292 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	3.48	□□□□□ -1.85	2e-12	■□□□□ 9.2
TTC3-214	ENST00000472398	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	C5AR2	Q9P296	337 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RPS6KA6	Q9UK32	745 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398		A0A1B0GTH6	734 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CCDC78	A2IDD5	438 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TTC34	A8MYJ7	566 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398		H7BY64	318 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ACKR2	O00590	384 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TEX28	O15482	410 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	POLR2D	O15514	142 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PTP4A3	O75365	173 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DAB1	O75553	588 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PDGFA	P04085	211 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SOD2	P04179	222 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SLFN14	P0C7P3	912 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	JMJD7	P0C870	316 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PRR35	P0CG20	571 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PYGM	P11217	842 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	BMP1	P13497	986 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CSF2RA	P15509	400 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	GUCY1A2	P33402	732 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TXLNA	P40222	546 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ETV3	P41162	512 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DHPS	P49366	369 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MAPK10	P53779	464 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DSTN	P60981	165 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TRA2B	P62995	288 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CBX1	P83916	185 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CDK17	Q00537	523 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MAP3K12	Q12852	859 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	BLMH	Q13867	455 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DOC2A	Q14183	400 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SMAD2	Q15796	467 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LETM2	Q2VYF4	491 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FDX2	Q6P4F2	183 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	KLC3	Q6P597	504 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DPP9	Q86TI2	863 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RSPH3	Q86UC2	560 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FAM160B2	Q86V87	743 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SLITRK4	Q8IW52	837 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CARF	Q8N187	725 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	FAM13C	Q8NE31	585 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	EDEM1	Q92611	657 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RUBCN	Q92622	972 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ABHD17A	Q96GS6	310 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ARL5B	Q96KC2	179 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZFP42	Q96MM3	310 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NTMT1	Q9BV86	223 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NT5C3A	Q9H0P0	336 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	PARVG	Q9HBI0	331 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	NPHS2	Q9NP85	383 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	SRPK3	Q9UPE1	567 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CORO2B	Q9UQ03	480 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZNF335	Q9H4Z2	1342 aa	Predicted RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	RSPH10B2	B2RC85	870 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398		H0YAE9	185 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398		H7C1W4	665 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	YKT6	O15498	198 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	EXTL3	O43909	919 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZEB2	O60315	1214 aa		3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	ZC3H11A	O75152	810 aa	Known RBP eCLIP	3.47	□□□□□ -1.85
TTC3-214	ENST00000472398	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85

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