RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS19P49795 217 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PPP2R2BQ00005 443 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 LAPTM5Q13571 262 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 GRM2Q14416 872 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS21Q2M5E4 152 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 KCTD21Q4G0X4 260 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 AKAP4Q5JQC9 854 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF600Q6ZNG1 722 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 FRA10AC1Q70Z53 315 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PEX26Q7Z412 305 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NECAB1Q8N987 351 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TTLL11Q8NHH1 800 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 HERVK_113Q902F9 699 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 BORCS5Q969J3 196 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CCDC77Q9BR77 488 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 UBAC1Q9BSL1 405 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CALN1Q9BXU9 219 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ABCG4Q9H172 646 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 THAP9Q9H5L6 903 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 RUBCNLQ9H714 662 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 MARCH7Q9H992 704 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 POLD4Q9HCU8 107 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CD209Q9NNX6 404 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PIM2Q9P1W9 311 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SNX12Q9UMY4 172 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 DNM3Q9UQ16 869 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CNTNAP1P78357 1384 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 MYH7P12883 1935 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ENPP3O14638 875 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 AREL1O15033 823 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ACSL4O60488 711 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PRLP01236 227 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CPA1P15085 419 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 EVI2BP34910 448 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFA8P51970 172 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF844Q08AG5 666 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 MED21Q13503 144 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SQLEQ14534 574 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR72Q3MJ13 1102 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP221Q4G0U5 840 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 BEND3Q5T5X7 828 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 KIF6Q6ZMV9 814 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 VSIG1Q86XK7 387 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 USP38Q8NB14 1042 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NRBF2Q96F24 287 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ACAP3Q96P50 834 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 VPS35Q96QK1 796 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 FANCEQ9HB96 536 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 STMN3Q9NZ72 180 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 AK5Q9Y6K8 562 aa6.98□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 BACH1O14867 736 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 RGS13O14921 159 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 VILLO15195 856 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC22A1O15245 554 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ADCY6O43306 1168 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 GPC4O75487 556 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 NDUFA10O95299 355 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 P4HA1P13674 534 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF18P17022 549 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 PRKAR1BP31321 381 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGGTB-208ENST00000471759 LBX1P52954 281 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms