RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462694.1

PTEN-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 2

Gene PTEN, Length 383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-202ENST00000462694 PACSIN1Q9BY11 444 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 ARNT2Q9HBZ2 717 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 SPON1Q9HCB6 807 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 L1RE1Q9UN81 338 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa5.98□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 PLIN1O60240 522 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 HAUS5O94927 633 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 GNAI3P08754 354 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 GNAI1P63096 354 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 ICAM4Q14773 271 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 VPS72Q15906 364 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 KSR2Q6VAB6 950 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 MAEAQ7L5Y9 396 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 FAM90A1Q86YD7 464 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 SH2D3CQ8N5H7 860 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 TTC9BQ8N6N2 239 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 FAM156AQ8NDB6 213 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 EDAQ92838 391 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 ARMT1Q9H993 441 aa5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PTEN-202ENST00000462694 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 HK1P19367 917 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ACO1P21399 889 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PIK3CGP48736 1102 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 UBXN2BQ14CS0 331 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CCDC93Q567U6 631 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 Q6ZSN1 163 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PALM2Q8IXS6 379 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 RNF169Q8NCN4 708 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 OR10H5Q8NGA6 315 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 RLIMQ9NVW2 624 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 JKAMPQ9P055 326 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 POGKQ9P215 609 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 JAG2Q9Y219 1238 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 TCAF1Q9Y4C2 921 aa5.96□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 GOLIM4O00461 696 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PRRG2O14669 202 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SLC43A1O75387 559 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SBK3P0C264 359 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PHKG2P15735 406 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SELENOPP49908 381 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 RABGGTBP53611 331 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CSRP2Q16527 193 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 KIAA0753Q2KHM9 967 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 LCE4AQ5TA78 99 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ZNF365Q70YC5 407 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 HTR3DQ70Z44 454 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PJA1Q8NG27 643 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 GPR87Q9BY21 358 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CD248Q9HCU0 757 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 FBXO34Q9NWN3 711 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CFAP97Q9P2B7 532 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa5.95□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 A0A1W2PPL8 197 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 CFAP69A5D8W1 941 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 FRS3O43559 492 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ANXA1P04083 346 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SLC6A4P31645 630 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 MAN2A2P49641 1150 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SPATS1Q496A3 300 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 MAP9Q49MG5 647 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 COBLL1Q53SF7 1204 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 EMC10Q5UCC4 262 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 RNF220Q5VTB9 566 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 C1QL3Q5VWW1 255 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 SWSAP1Q6NVH7 229 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PPP1R3BQ86XI6 285 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 PDSS2Q86YH6 399 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 FITM2Q8N6M3 262 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 FBXO41Q8TF61 875 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 LRTOMTQ8WZ04 291 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 NT5C1BQ96P26 610 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ADOQ96SZ5 270 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 MNTQ99583 582 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 GPR20Q99678 358 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 C1orf43Q9BWL3 253 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 GSTO2Q9H4Y5 243 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 BRD9Q9H8M2 597 aa5.94□□□□□ -1.46
PTEN-202ENST00000462694 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms