RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452765.6

SH3BP2-204, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-204ENST00000452765 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF263O14978 683 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 SGPL1O95470 568 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ASIC2Q16515 512 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 MYRIPQ8NFW9 859 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 NT5C1BQ96P26 610 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.53■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 EVI5O60447 810 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 NDUFA10O95299 355 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 AXLP30530 894 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ENPEPQ07075 957 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF12Q96FN5 646 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 SCN1AP35498 2009 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 IL18RAPO95256 599 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 PTK2Q05397 1052 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ZFP42Q96MM3 310 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ERVK-5Q9HDB9 667 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa22.52■■□□□ 1.2
SH3BP2-204ENST00000452765 ITGB3P05106 788 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SOX5P35711 763 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PAK2Q13177 524 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 REXO1L1PQ8IX06 675 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CCDC42Q96M95 316 aa22.51■■□□□ 1.19
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SH3BP2-204ENST00000452765 TMEM132DQ14C87 1099 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SNX27Q96L92 541 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa22.51■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 PPEF2O14830 753 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TNNC2P02585 160 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 STAT1P42224 750 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SURF1Q15526 300 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 WDR44Q5JSH3 913 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RNF169Q8NCN4 708 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CXorf38Q8TB03 319 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CACNG4Q9UBN1 327 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 GPR182O15218 404 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SERPING1P05155 500 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 KIF11P52732 1056 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM26DQ5JW98 314 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ZNF710Q8N1W2 664 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.191e-6■■■■□ 19.7
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SH3BP2-204ENST00000452765 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 C1orf112Q9NSG2 853 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM105AQ9NUU6 356 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SCN5AQ14524 2016 aa22.5■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RCCD1A6NED2 376 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CYP26A1O43174 497 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CD4P01730 458 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TRPC3Q13507 836 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ALKAL1Q6UXT8 129 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ADAM2Q99965 735 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 DEF6Q9H4E7 631 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM10Q9UDY6 481 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 POLIQ9UNA4 740 aa22.49■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 YARSP54577 528 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 CDK17Q00537 523 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 GPNMBQ14956 572 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC20A1Q8WUM9 679 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 A0A087X0T9 212 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 AKR1B10O60218 316 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 FAM228BP0C875 321 aa22.48■■□□□ 1.19
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SH3BP2-204ENST00000452765 MFAP3P55082 362 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 TRIM60Q495X7 471 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ARMC5Q96C12 935 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 DPP3Q9NY33 737 aa22.48■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SLC47A2Q86VL8 602 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 OLIG1Q8TAK6 271 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 SCLYQ96I15 445 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 AGAP1Q9UPQ3 857 aa22.47■■□□□ 1.19
SH3BP2-204ENST00000452765 WEE2P0C1S8 567 aa22.47■■□□□ 1.19
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