RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 SPATA1Q5VX52 437 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CENPPQ6IPU0 288 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 FUT10Q6P4F1 479 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF516Q92618 1163 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TCF25Q9BQ70 676 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 COLEC11Q9BWP8 271 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ZBP1Q9H171 429 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TLR9Q9NR96 1032 aa11.94□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ZNF233A6NK53 670 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC01565O15544 149 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TADA2AO75478 443 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LDHAP00338 332 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DLATP10515 647 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RPL17P18621 184 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 NR2F2P24468 414 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CA8P35219 290 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PPM1AP35813 382 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 KRT17Q04695 432 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 KYAT1Q16773 422 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DPCR1Q3MIW9 517 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TIGD5Q53EQ6 642 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RTP2Q5QGT7 225 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf220Q5T0J3 134 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 VN1R2Q8NFZ6 395 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CXorf38Q8TB03 319 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 NELFBQ8WX92 580 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MFSD14AQ96MC6 490 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 IGFLR1Q9H665 355 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DPP3Q9NY33 737 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 SIX4Q9UIU6 781 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAM28Q9UKQ2 775 aa11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAM12O43184 909 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LRRN2O75325 713 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 IL18RAPO95256 599 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CXCL14O95715 111 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM49P0CI25 452 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIM49CP0CI26 452 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TKTP29401 623 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LRPAP1P30533 357 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CDR1P51861 262 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 HYAL1Q12794 435 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ADAM9Q13443 819 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PSMD6Q15008 389 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPN14Q15678 1187 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 FAM171A1Q5VUB5 890 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf57Q5W0N0 161 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TTI2Q6NXR4 508 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TMC7Q7Z402 723 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CEP57Q86XR8 500 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC9A9Q8IVB4 645 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf127Q8N9H9 656 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ASB7Q9H672 318 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC38A7Q9NVC3 462 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 INTS13Q9NVM9 706 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 BRWD1Q9NSI6 2320 aa11.92□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ANO9A1A5B4 782 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 C2orf71A6NGG8 1288 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PIRO00625 290 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 LILRB3O75022 631 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 SOD2P04179 222 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 ITGB3P05106 788 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CTSAP10619 480 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CCNE1P24864 410 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 NRIP1P48552 1158 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE3AQ05086 875 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 PTPROQ16827 1216 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 KIAA0319Q5VV43 1072 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 CD302Q8IX05 232 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 BEST2Q8NFU1 509 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 GOLGA5Q8TBA6 731 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 RSPH1Q8WYR4 309 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 BORCS6Q96GS4 357 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa11.91□□□□□ -0.5
RPRD1B-202ENST00000449186 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.91□□□□□ -0.53e-8■■■■■ 56.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms