RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448190.6

SNHG4-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 4, humanhuman

TSL 4

Gene SNHG4, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG4-201ENST00000448190 ASB7Q9H672 318 aa14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 MAN1B1Q9UKM7 699 aa14.5□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 CHST7Q9NS84 486 aa14.49□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.094e-7■■■□□ 15.8
SNHG4-201ENST00000448190 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 SPTLC1O15269 473 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 TEX28O15482 410 aa14.47□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 XPOTO43592 962 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 CD44P16070 742 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 MCM4P33991 863 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 NDUFV1P49821 464 aa14.47□□□□□ -0.09
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SNHG4-201ENST00000448190 C9orf57Q5W0N0 161 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 CEP135Q66GS9 1140 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.098e-76■■■■□ 24.7
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SNHG4-201ENST00000448190 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 EFHBQ8N7U6 833 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 GOLGA5Q8TBA6 731 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 FBXL18Q96ME1 805 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 KIAA1586Q9HCI6 787 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 CLEC1BQ9P126 229 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 AGAP1Q9UPQ3 857 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 DERAQ9Y315 318 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 C2CD2Q9Y426 696 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 TCHHQ07283 1943 aa14.47□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 MYO7AQ13402 2215 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 PTPRJQ12913 1337 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 TMEM189-UBE2V1I3L0A0 370 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 TRAPPC3O43617 180 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 NCK2O43639 380 aa14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 CALUO43852 315 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
SNHG4-201ENST00000448190 KIF20AO95235 890 aa14.46□□□□□ -0.09
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