RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 ARSHQ5FYA8 562 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RTP2Q5QGT7 225 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 C1orf186Q6ZWK4 172 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CEP57Q86XR8 500 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DDX12PQ92771 950 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NFKBIZQ9BYH8 718 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SNTG2Q9NY99 539 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP13.61□□□□□ -0.239e-7■■□□□ 14.3
PRAME-208ENST00000438888 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 KRBA1A5PL33 1030 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PROB1E7EW31 1015 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 KIF4AO95239 1232 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DMDP11532 3685 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 GUCY2CP25092 1073 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 ANGPT1Q15389 498 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NT5DC1Q5TFE4 455 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DYMQ7RTS9 669 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CCDC105Q8IYK2 499 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DTWD2Q8NBA8 298 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 MCPH1Q8NEM0 835 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SPATA20Q8TB22 786 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 BSNDQ8WZ55 320 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DNAJC19Q96DA6 116 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 GSDMAQ96QA5 445 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RTP3Q9BQQ7 232 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CXCL16Q9H2A7 254 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 POLD4Q9HCU8 107 aa13.6□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 N4BP3O15049 544 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 KLRC4O43908 158 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 TBCAO75347 108 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RECQL4O94761 1208 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RPN1P04843 607 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PRKCBP05771 671 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 IDEP14735 1019 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NTHL1P78549 312 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 TUSC3Q13454 348 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 FAM171A1Q5VUB5 890 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SASS6Q6UVJ0 657 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CYP26C1Q6V0L0 522 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 UNC13DQ70J99 1090 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 CCDC65Q8IXS2 484 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SLC44A3Q8N4M1 653 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 DEPTORQ8TB45 409 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 GPR152Q8TDT2 470 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 SNX27Q96L92 541 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 REEP2Q9BRK0 252 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 KIFC3Q9BVG8 833 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 TIPINQ9BVW5 301 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 PRKD2Q9BZL6 878 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 TBC1D17Q9HA65 648 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 RMND1Q9NWS8 449 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 FNIP2Q9P278 1114 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 EPS15L1Q9UBC2 864 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 POLIQ9UNA4 740 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 GDAQ9Y2T3 454 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 NUMBLQ9Y6R0 609 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 VPS13AQ96RL7 3174 aa13.59□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.23
PRAME-208ENST00000438888 BIN1O00499 593 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PTGESO14684 152 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 CCL16O15467 120 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 ZMYND10O75800 440 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 EDN1P05305 212 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 SRFP11831 508 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 LAMP2P13473 410 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 CREMQ03060 361 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 KCNB1Q14721 858 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PSMD5Q16401 504 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 KMT5BQ4FZB7 885 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 GLRA4Q5JXX5 417 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 LIN9Q5TKA1 542 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 EEF1DP3Q658K8 133 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 LILRA6Q6PI73 481 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 TRIML1Q8N9V2 468 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 HDAC7Q8WUI4 952 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 PRIMPOLQ96LW4 560 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 ADPGKQ9BRR6 497 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 TTPALQ9BTX7 342 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 C2orf40Q9H1Z8 148 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 FZD8Q9H461 694 aa13.58□□□□□ -0.24
PRAME-208ENST00000438888 EXOC1Q9NV70 894 aa13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms