RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 CEACAM1P13688 526 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MCM7P33993 719 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MPLP40238 635 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ME1P48163 572 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GRM2Q14416 872 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF174Q15697 407 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 WDR44Q5JSH3 913 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PPP4R3AQ6IN85 833 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 KBTBD6Q86V97 674 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 SPEM1Q8N4L4 309 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM60Q9H2L4 133 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RSAD1Q9HA92 442 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 VPS45Q9NRW7 570 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FNIP2Q9P278 1114 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CACNA1EQ15878 2313 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PTPRBP23467 1997 aa11.14□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF862O60290 1169 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 NEMFO60524 1076 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CUTAO60888 179 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CYP3A4P08684 503 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CYP3A7P24462 503 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CIITAP33076 1130 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PRPHP41219 470 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RAP1GAPP47736 663 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RAB27AP51159 221 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GRIN1Q05586 938 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PTGDRQ13258 359 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 SLC5A9Q2M3M2 681 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ADALQ6DHV7 355 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZS52 159 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 POTEDQ86YR6 584 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 DEFB124Q8NES8 71 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 DNASE1L2Q92874 299 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 LENG9Q96B70 501 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MCRS1Q96EZ8 462 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 LRIG1Q96JA1 1093 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 BRD9Q9H8M2 597 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MIOSQ9NXC5 875 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PTPRDP23468 1912 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FAM86B1E9PN63 330 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 LAD1O00515 517 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RPP40O75818 363 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 C8AP07357 584 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 HNRNPA1P09651 372 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FAM86B2P0C5J1 330 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 OR52Z1P0C646 297 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CCDC192P0DO97 292 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 LIG1P18858 919 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 FCARP24071 287 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PXNP49023 591 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 USP11P51784 963 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 DSC1Q08554 894 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 IL17AQ16552 155 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PPM1LQ5SGD2 360 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 UBXN11Q5T124 520 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RESP18Q5W5W9 173 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 SHC4Q6S5L8 630 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 WDR5BQ86VZ2 330 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 KSR1Q8IVT5 923 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 GAB3Q8WWW8 586 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 RABGGTAQ92696 567 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PGBD4Q96DM1 585 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 MTMR9Q96QG7 549 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 IGSF5Q9NSI5 407 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 KANSL3Q9P2N6 904 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 HPSEQ9Y251 543 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PIAS3Q9Y6X2 628 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CFAP46Q8IYW2 2715 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 ADAM12O43184 909 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CAPNS1P04632 268 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4B-211ENST00000429899 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms