RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403258.1

ACTBP8-201, Transcript of actin, beta pseudogene 8, humanhuman

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Gene ACTBP8, Length 1,108 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP8-201ENST00000403258 USP37Q86T82 979 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SPPL3Q8TCT6 385 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TMC2Q8TDI7 906 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CEP63Q96MT8 703 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FNBP1Q96RU3 617 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PAAF1Q9BRP4 392 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 INTS13Q9NVM9 706 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 MTMR10Q9NXD2 777 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SCN1AP35498 2009 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PODXLO00592 558 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 GRM6O15303 877 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 KIF4AO95239 1232 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CLDN10P78369 228 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 NFKBIBQ15653 356 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PTPROQ16827 1216 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM186BQ8IYM0 893 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 POF1BQ8WVV4 589 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FAM161BQ96MY7 647 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CACNG4Q9UBN1 327 aa16.5■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ANO9A1A5B4 782 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PAX3P23760 479 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 AP3M2P53677 418 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 BFSP1Q12934 665 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 STX1AQ16623 288 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FUT10Q6P4F1 479 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 GUCD1Q96NT3 240 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TLR9Q9NR96 1032 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ANO10Q9NW15 660 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DPP3Q9NY33 737 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ITGA11Q9UKX5 1188 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PTPRJQ12913 1337 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 RFXAPO00287 272 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PIRO00625 290 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 B3GAT3O94766 335 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TNNC2P02585 160 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 SOD2P04179 222 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DLATP10515 647 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 KRT13P13646 458 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TNNI1P19237 187 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 STX17P56962 302 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 C9orf57Q5W0N0 161 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 PLEKHO2Q8TD55 490 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CCDC127Q96BQ5 260 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 BORCS6Q96GS4 357 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ZNF560Q96MR9 790 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 ZBP1Q9H171 429 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 F8W810 466 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 IKBKBO14920 756 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 FSCN2O14926 492 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TRAPPC3O43617 180 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TADA2AO75478 443 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 DNAJB1P25685 340 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 VAMP7P51809 220 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CAMK1Q14012 370 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 TIGD5Q53EQ6 642 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CD300LGQ6UXG3 332 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 GPR65Q8IYL9 337 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 C1orf127Q8N9H9 656 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 CXorf38Q8TB03 319 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 HASPINQ8TF76 798 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 RABGGTAQ92696 567 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTBP8-201ENST00000403258 MED15Q96RN5 788 aa16.47■□□□□ 0.23
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