RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 KCNN4O15554 427 aa22.54■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.52■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 LONRF1Q17RB8 773 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 TKFCQ3LXA3 575 aa22.52■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 HDAC4P56524 1084 aa22.52■■□□□ 1.2
ANKRD28-201ENST00000399451 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.52■■□□□ 1.2
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ANKRD28-201ENST00000399451 PSMD14O00487 310 aa22.51■■□□□ 1.19
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ANKRD28-201ENST00000399451 SERPINB4P48594 390 aa22.51■■□□□ 1.19
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ANKRD28-201ENST00000399451 AGR3Q8TD06 166 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
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ANKRD28-201ENST00000399451 RPS6KA5O75582 802 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF543Q08ER8 600 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.51■■□□□ 1.19
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ANKRD28-201ENST00000399451 NBPF15Q8N660 670 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.51■■□□□ 1.19
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ANKRD28-201ENST00000399451 C18orf8Q96DM3 657 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SLC24A3Q9HC58 644 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 KCND2Q9NZV8 630 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 TBX3O15119 743 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CETPP11597 493 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP22.51■■□□□ 1.197e-7■■■□□ 16.4
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ANKRD28-201ENST00000399451 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 GGT7Q9UJ14 662 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 SYF2O95926 243 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 CYP2C19P33261 490 aa22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP22.5■■□□□ 1.19
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa22.5■■□□□ 1.19
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