RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000396667.7

TMEM106B-201, Transcript of transmembrane protein 106B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM106B, Length 12,539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106B-201ENST00000396667 FGFR2P21802 821 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ERFP50548 548 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GSDMDP57764 484 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 STAT4Q14765 748 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GRK7Q8WTQ7 553 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ATP9BO43861 1147 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 OCM2P0CE71 109 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RAP1GAPP47736 663 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 USP41Q3LFD5 358 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ERAP2Q6P179 960 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PDXDC1Q6P996 788 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CAMKK1Q8N5S9 505 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MYLIPQ8WY64 445 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ASNSD1Q9NWL6 643 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MCF2LO15068 1137 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PDHBP11177 359 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 FOXM1Q08050 763 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TEAD4Q15561 434 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RIOX2Q8IUF8 465 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CXorf40AQ8TE69 158 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 FOPNLQ96NB1 174 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PHF20Q9BVI0 1012 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TSSK1BQ9BXA7 367 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GCNT4Q9P109 453 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 HDAC6Q9UBN7 1215 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF197O14709 1029 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MAFGO15525 162 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 SOX11P35716 441 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GPR158Q5T848 1215 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 OVOS1Q6IE37 1185 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RDM1Q8NG50 284 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 BRI3BPQ8WY22 251 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PASKQ96RG2 1323 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TNS2Q63HR2 1409 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 KRIT1O00522 736 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 GABRR2P28476 465 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 C2orf27AQ580R0 203 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 LGSNQ5TDP6 509 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 NUDT5Q9UKK9 219 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 H3BQ06 376 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PODXLO00592 558 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 APODP05090 189 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 OXCT1P55809 520 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ARID5BQ14865 1188 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ZNF284Q2VY69 593 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 AK8Q96MA6 479 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TLK1Q9UKI8 766 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MAP3K1Q13233 1512 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CPP00450 1065 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ARP10275 920 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TMEM35BQ8NCS4 154 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 BARHL2Q9NY43 387 aa4.7□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ARHGAP10A1A4S6 786 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 PNPLA4P41247 253 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 METTL7BQ6UX53 244 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 APBB2Q92870 758 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TSGA10Q9BZW7 698 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 DUOXA2Q1HG44 320 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MFN1Q8IWA4 741 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 ALLCQ8N6M5 410 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 TRIM11Q96F44 468 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 MAGED4Q96JG8 741 aa4.69□□□□□ -1.66
TMEM106B-201ENST00000396667 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms