RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373184.5

PTPRT-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,483 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-202ENST00000373184 RNF217Q8TC41 542 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EEF2KMTQ96G04 330 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RIC8BQ9NVN3 520 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 MAPK1P28482 360 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HADHAP40939 763 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HPCAP84074 193 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CNGA3Q16281 694 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CCNYL1Q8N7R7 359 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EXT2Q93063 718 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NYAP2Q9P242 653 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZNF263O14978 683 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SLC16A4O15374 487 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TBC1D4O60343 1298 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PYGMP11217 842 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NCKAP1LP55160 1127 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SZRD1Q7Z422 152 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CHST13Q8NET6 341 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TEKT4Q8WW24 435 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RAPGEF5Q92565 580 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 AIPL1Q9NZN9 384 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PAK5Q9P286 719 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 MAD2L2Q9UI95 211 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZMYND10O75800 440 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 POLBP06746 335 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ATP1A3P13637 1013 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SV2CQ496J9 727 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SYTL3Q4VX76 610 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 UGT3A1Q6NUS8 523 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 LRRC43Q8N309 656 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PHF21AQ96BD5 680 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RBBP8Q99708 897 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DSEQ9UL01 958 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FIS1Q9Y3D6 152 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EMSYQ7Z589 1322 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZBBXA8MT70 800 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 S100A5P33763 92 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 COG2Q14746 738 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NOTUMQ6P988 496 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC126Q96EE4 140 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RIT2Q99578 217 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PRR36Q9H6K5 1346 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DCCP43146 1447 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PSMD14O00487 310 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 STAT5BP51692 787 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ACTR2P61160 394 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 USP17L6PQ6QN14 398 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SPATA16Q9BXB7 569 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 VPS11Q9H270 941 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TMEM8AQ9HCN3 771 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ERAP1Q9NZ08 941 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SEPT3Q9UH03 358 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NWD1Q149M9 1564 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FAM47DPA6NHR8 397 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 F5H6K3 240 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CYP2C8P10632 490 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CPT1AP50416 773 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KLRC3Q07444 240 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 KIF12Q96FN5 646 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TRABDQ9H4I3 376 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 A8MXQ7 604 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TOMM70O94826 608 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 FMO5P49326 533 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 TAS2R42Q7RTR8 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 OR6P1Q8NGX9 317 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PTPRN2Q92932 1015 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CDYLQ9Y232 598 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NCOA4Q13772 614 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RASGRP2Q7LDG7 609 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 YAF2Q8IY57 180 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 RMDN1Q96DB5 314 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 NAT9Q9BTE0 207 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 SNX24Q9Y343 169 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 CYP27B1O15528 508 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ARIH2O95376 493 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ETFBP38117 255 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 PPM1NQ8N819 430 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-202ENST00000373184 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms