RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369862.1

AMIGO1-201, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene AMIGO1, Length 2,229 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-201ENST00000369862 CYFIP1Q7L576 1253 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CPNE8Q86YQ8 564 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF516Q92618 1163 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 IFT74Q96LB3 600 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC134Q9H6E4 229 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 HAUS2Q9NVX0 235 aa25.53■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 MAP2K2P36507 400 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CNTN2Q02246 1040 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 EMC2Q15006 297 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CCT8L1PA6NM43 557 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 GRIN3BO60391 1043 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 CALCAP01258 141 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PDE6CP51160 858 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 ITIH4Q14624 930 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 PIGWQ7Z7B1 504 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 BTBD6Q96KE9 485 aa25.52■■□□□ 1.68
AMIGO1-201ENST00000369862 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CYP1A2P05177 515 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 WNT7BP56706 349 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 USP37Q86T82 979 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 RPAINQ86UA6 219 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CD101Q93033 1021 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TMEM143Q96AN5 459 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 NUP85Q9BW27 656 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 GPRC5DQ9NZD1 345 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MTUS1Q9ULD2 1270 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 RIPK2O43353 540 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 RARGP13631 454 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MAGEC3Q8TD91 643 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ART4Q93070 314 aa25.51■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SMIM23A6NLE4 172 aa25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 STXBP2Q15833 593 aa25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF653Q96CK0 615 aa25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MYPNQ86TC9 1320 aa25.5■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ATG7O95352 703 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 COILP38432 576 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ASAP3Q8TDY4 903 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 GTF3C4Q9UKN8 822 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 EXTL3O43909 919 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PYGMP11217 842 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ICAM3P32942 547 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 LIG4P49917 911 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 GCNT1Q02742 428 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ENPEPQ07075 957 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TREML2Q5T2D2 321 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 DLK2Q6UY11 383 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CCDC105Q8IYK2 499 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 HAPLN2Q9GZV7 340 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ZNF302Q9NR11 478 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PASKQ96RG2 1323 aa25.49■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ATP2C2O75185 946 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 GSTA1P08263 222 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 FGFR4P22455 802 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SH3D19Q5HYK7 790 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SEPT14Q6ZU15 432 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SAMD15Q9P1V8 674 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 RASGRF2O14827 1237 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 OATP04181 439 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 KRT5P13647 590 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 CLDN10P78369 228 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 WLSQ5T9L3 541 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 MFSD5Q6N075 450 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 TAOK1Q7L7X3 1001 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 LRRC34Q8IZ02 419 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 H0YCG3 227 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 GLRA2P23416 452 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 DNERQ8NFT8 737 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PORCNQ9H237 461 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 STYXL1Q9Y6J8 313 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 PTPRFP10586 1907 aa25.47■■□□□ 1.67
AMIGO1-201ENST00000369862 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.8 ms