RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362858.1

RNU6-655P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 655, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-655P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 LRCH1Q9Y2L9 728 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MED16Q9Y2X0 877 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 KCTD3Q9Y597 815 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZMYM3Q14202 1370 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A087WV62 115 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1B0GTL3 188 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 A0A1W2PPC4 97 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM43BA6NCK2 446 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PRSS29PA6NIE9 313 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RFXAPO00287 272 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MATN2O00339 956 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC26A4O43511 780 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC43A1O75387 559 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 FGF18O76093 207 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SASH1O94885 1247 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ABHD16AO95870 558 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 FGAP02671 866 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAP2AP10114 183 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP5JP18859 108 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC6A4P31645 630 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 HALP42357 657 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 GZMKP49863 264 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 APBA1Q02410 837 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNFAIP2Q03169 654 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PMS2P11Q13670 270 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RAPGEF1Q13905 1077 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP2B3Q16720 1220 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RNF151Q2KHN1 245 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC93Q567U6 631 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 C3orf38Q5JPI3 329 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATG14Q6ZNE5 492 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 FRMD5Q7Z6J6 570 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MICU3Q86XE3 530 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 Q8N3U1 123 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ANKRD42Q8N9B4 389 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYRIPQ8NFW9 859 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR5M3Q8NGP4 307 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PPM1EQ8WY54 764 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 MYOCQ99972 504 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 NDC1Q9BTX1 674 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 BRIP1Q9BX63 1249 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SMURF2Q9HAU4 748 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ST6GALNAC1Q9NSC7 600 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RLIMQ9NVW2 624 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CDC23Q9UJX2 597 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZDHHC9Q9Y397 364 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 NR2E1Q9Y466 385 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 UBE2QL1A1L167 161 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TCAF2A6NFQ2 919 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 B5MCH6 92 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 BTN3A1O00481 513 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 APOL1O14791 398 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PJA2O43164 708 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 GJB1P08034 283 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RARBP10826 455 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PAX3P23760 479 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 NPEPPSP55786 919 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RPS16P62249 146 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CREMQ03060 361 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 PTH1RQ03431 593 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 RIN1Q13671 783 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 TRIM14Q14142 442 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 KIF22Q14807 665 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC35G1Q2M3R5 365 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF568Q3ZCX4 644 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF385BQ569K4 471 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF529Q6P280 563 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF783Q6ZMS7 281 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ZNF365Q70YC5 407 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 KBTBD2Q8IY47 623 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 GPR135Q8IZ08 494 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 CCDC33Q8N5R6 958 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 LINC01356Q8N9X3 169 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 ATP11CQ8NB49 1132 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 OR6B3Q8NGW1 331 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-655P-201ENST00000362858 SLC35B2Q8TB61 432 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49 ms