RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HTTP42858 3142 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 UCHL3P15374 230 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MXI1P50539 228 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MNAT1P51948 309 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MEA1Q16626 185 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KRT39Q6A163 491 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 WDR59Q6PJI9 974 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 BRSK2Q8IWQ3 736 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FNBP1Q96RU3 617 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CGRRF1Q99675 332 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PDE11AQ9HCR9 933 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NLRC4Q9NPP4 1024 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 OGFRQ9NZT2 677 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FBXL5Q9UKA1 691 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GINS2Q9Y248 185 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FHOD1Q9Y613 1164 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PCNTO95613 3336 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FAM200BP0CF97 657 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CD151P48509 253 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SLC7A5Q01650 507 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ITGA7Q13683 1181 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SNX17Q15036 470 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTGISQ16647 500 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SERINC5Q86VE9 423 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 THNSL1Q8IYQ7 743 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNF516Q92618 1163 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IP6K2Q9UHH9 426 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.52□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 A0A1B0GUA9 196 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TNNI1P19237 187 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CDR1P51861 262 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 IQCEQ6IPM2 695 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 GJB7Q6PEY0 223 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CATSPER4Q7RTX7 472 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RSPH3Q86UC2 560 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRIM42Q8IWZ5 723 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 WNT8BQ93098 351 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NACA2Q9H009 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 UNC93B1Q9H1C4 597 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KCND1Q9NSA2 647 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TRPV2Q9Y5S1 764 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PTPRJQ12913 1337 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 A0A1W2PQY0 241 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 M0QZ92 97 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 JAM2P57087 298 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 OSTNP61366 133 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CDK17Q00537 523 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MTF1Q14872 753 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SLMAPQ14BN4 828 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 KYAT1Q16773 422 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SV2AQ7L0J3 742 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 LCA5Q86VQ0 697 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ARRDC4Q8NCT1 418 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SEMA4DQ92854 862 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CHP1Q99653 195 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 PLAGL2Q9UPG8 496 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 COQ4Q9Y3A0 265 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 CENPFP49454 3210 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 STAG3L1P0CL83 205 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 AXLP30530 894 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SURF1Q15526 300 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 WDR49Q8IV35 697 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 TMEM192Q8IY95 271 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.51□□□□□ -1.37
CCR6-201ENST00000341935 FBXL13Q8NEE6 735 aa6.51□□□□□ -1.37
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