RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000339007.3

LRRC25-201, Transcript of leucine rich repeat containing 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC25, Length 2,415 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC25-201ENST00000339007 ZFATQ9P243 1243 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GRIN3BO60391 1043 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ARP10275 920 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RASSF2P50749 326 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KRT39Q6A163 491 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TRIM68Q6AZZ1 485 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 B3GNT9Q6UX72 402 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SLC17A8Q8NDX2 589 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 FAM13CQ8NE31 585 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 HELQQ8TDG4 1101 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 FAM81BQ96LP2 452 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 CFAP57Q96MR6 1250 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 EHMT1Q9H9B1 1298 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KCNQ5Q9NR82 932 aa19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ATRNL1Q5VV63 1379 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SPAG7O75391 227 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ADRB2P07550 413 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 MAGEA4P43358 317 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RAD23BP54727 409 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 CCNG2Q16589 344 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SP8Q8IXZ3 490 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 NT5C1BQ96P26 610 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 NUDCD1Q96RS6 583 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 HEMGNQ9BXL5 484 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TPBGLP0DKB5 382 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RALAP11233 206 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PLS3P13797 630 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PRUNE1Q86TP1 453 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DENND1AQ8TEH3 1009 aa19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 MROH7Q68CQ1 1323 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GOLGA8IPA6NC78 632 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GOLGA8JA6NMD2 632 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SLC18A1P54219 525 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PDK4Q16654 411 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DOK7Q18PE1 504 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 HAUS6Q7Z4H7 955 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SPOCK2Q92563 424 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ZDHHC15Q96MV8 337 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC37AA6NMS7 1700 aa19.48■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 VIL1P09327 827 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GPC3P51654 580 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 STAT2P52630 851 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 CBWD2Q8IUF1 395 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 LRRC8CQ8TDW0 803 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 CCDC127Q96BQ5 260 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TRABDQ9H4I3 376 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 FAM198AQ9UFP1 575 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 EDF1O60869 148 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 LINGO3P0C6S8 592 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GM2AP17900 193 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GTF2BQ00403 316 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PTP4A2Q12974 167 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 CMPK2Q5EBM0 449 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 WASHC2DQ5SRD0 308 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 LONP2Q86WA8 852 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TDRPQ86YL5 185 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 LMNTD2Q8IXW0 634 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 MCOLN2Q8IZK6 566 aa19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 T-ENOLP0DO92 83 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KRT5P13647 590 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ATP6V1C1P21283 382 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 PCK1P35558 622 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 P3H1Q32P28 736 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 C11orf91Q3C1V1 193 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 ZNF449Q6P9G9 518 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 GSTA5Q7RTV2 222 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SMC6Q96SB8 1091 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 IWS1Q96ST2 819 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 RIT2Q99578 217 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 FAM118BQ9BPY3 351 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KIAA1586Q9HCI6 787 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 TMEM8AQ9HCN3 771 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 SENP1Q9P0U3 644 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 MYBL1P10243 752 aa19.46■□□□□ 0.71
LRRC25-201ENST00000339007 KRT15P19012 456 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms