RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330233.11

CRIP1-201, Transcript of cysteine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CRIP1, Length 1,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1-201ENST00000330233 MYLIPQ8WY64 445 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 FNBP1Q96RU3 617 aa28.99■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PODXLO00592 558 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 B3GAT3O94766 335 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 NLRP12P59046 1061 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ADGRE1Q14246 886 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 RABGGTAQ92696 567 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TLR9Q9NR96 1032 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MARCH5Q9NX47 278 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CACNG4Q9UBN1 327 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP28.98■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TFAMQ00059 246 aaKnown RBP28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PAK1Q13153 545 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 KLHL40Q2TBA0 621 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 EFCAB13Q8IY85 973 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 DPP3Q9NY33 737 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 DACH1Q9UI36 760 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MTCH2Q9Y6C9 303 aa28.97■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TRAPPC3O43617 180 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 FOSL2P15408 326 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 DNAJB1P25685 340 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CASP4P49662 377 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PMS1P54277 932 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 WNT7BP56706 349 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 DUOXA2Q1HG44 320 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 USP37Q86T82 979 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 WDR49Q8IV35 697 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 VPS52Q8N1B4 723 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 MKNK1Q9BUB5 465 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM63CQ9P1W3 806 aa28.96■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 KIF4AO95239 1232 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TNNI1P19237 187 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 PAX3P23760 479 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CAMK1Q14012 370 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 FUT10Q6P4F1 479 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 SASS6Q6UVJ0 657 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TMC7Q7Z402 723 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TMC2Q8TDI7 906 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CCDC127Q96BQ5 260 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 INTS13Q9NVM9 706 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 CTNND2Q9UQB3 1225 aa28.95■■■□□ 2.23
CRIP1-201ENST00000330233 TRIM49BA6NDI0 452 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 AKAP3O75969 853 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 EFEMP2O95967 443 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TNNC2P02585 160 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 SOD2P04179 222 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TMEM191BP0C7N4 346 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 DLATP10515 647 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ENPEPQ07075 957 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 FAM186BQ8IYM0 893 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CGRRF1Q99675 332 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 RWDD2AQ9UIY3 292 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 NUB1Q9Y5A7 615 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 SCN1AP35498 2009 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CDH23Q9H251 3354 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ANO9A1A5B4 782 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 F8W810 466 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 KRT13P13646 458 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 AP3M2P53677 418 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ERVFC1P60507 584 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TTI2Q6NXR4 508 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 HASPINQ8TF76 798 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CEP63Q96MT8 703 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 GPR62Q9BZJ7 368 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa28.94■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 PIRO00625 290 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 FSCN2O14926 492 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 EPB41P11171 864 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 GUCY2FP51841 1108 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CLDN10P78369 228 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 USP41Q3LFD5 358 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TIGD5Q53EQ6 642 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 C9orf57Q5W0N0 161 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 CD300LGQ6UXG3 332 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 TCF25Q9BQ70 676 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 VN1R3Q9BXE9 311 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ZBP1Q9H171 429 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 ITGA11Q9UKX5 1188 aa28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
CRIP1-201ENST00000330233 IKBKBO14920 756 aa28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms