RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 CRYGNQ8WXF5 182 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PARVGQ9HBI0 331 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 A8MXQ7 604 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MAGEA4P43358 317 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ACSBG2Q5FVE4 666 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RFWD3Q6PCD5 774 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DSTYKQ6XUX3 929 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZCCHC9Q8N567 271 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 EPS8L1Q8TE68 723 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NCSTNQ92542 709 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PCDHB18PQ96TA0 734 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NEU2Q9Y3R4 380 aa20.51■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 A0A1B0GVG6 124 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L15C9J2P7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L11C9JVI0 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L18D6R9N7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L22D6RA61 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L17D6RBQ6 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L19D6RCP7 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L20D6RJB6 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GSC2O15499 205 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CYP2J2P51589 502 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP4P98171 946 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L24Q0WX57 530 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PRR16Q569H4 304 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FAM182BQ5T319 152 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 HHATQ5VTY9 493 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF365Q70YC5 407 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 C9orf72Q96LT7 481 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KIAA1586Q9HCI6 787 aa20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FAM170AA1A519 330 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CA4P22748 312 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RANBP1P43487 201 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SIK1P57059 783 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF653Q96CK0 615 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GRID1Q9ULK0 1009 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FAM196BA6NMK8 535 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RGL2O15211 777 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 TBX10O75333 385 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RRM1P23921 792 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GSTT1P30711 240 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ARHGAP24Q8N264 748 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 MCUR1Q96AQ8 359 aa20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP20.49■□□□□ 0.874e-8■■■□□ 15.5
NOP56-201ENST00000329276 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GYG2O15488 501 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KRT36O76013 467 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 HAUS5O94927 633 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KRT15P19012 456 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GCAP28676 217 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 SERPINB4P48594 390 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 IZUMO3Q5VZ72 239 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZNF720Q7Z2F6 126 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ATG4AQ8WYN0 398 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 BTBD6Q96KE9 485 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 USP17L10C9JJH3 530 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CREB3O43889 395 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 TYROBPO43914 113 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 COG2Q14746 738 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 GRIK5Q16478 980 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 FAM71AQ8IYT1 594 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 KLHL23Q8NBE8 558 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NSL1Q96IY1 281 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa20.48■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 DNAJC6O75061 913 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 VPS72Q15906 364 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CPNE8Q86YQ8 564 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 LENG9Q96B70 501 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 OPTNQ96CV9 577 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 PWWP2AQ96N64 755 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NYXQ9GZU5 481 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 NPHS2Q9NP85 383 aa20.47■□□□□ 0.87
NOP56-201ENST00000329276 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.7 ms