RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324685.10

RNF40-201, Transcript of ring finger protein 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RNF40, Length 5,634 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40-201ENST00000324685 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 TRIM9Q9C026 710 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 KCND2Q9NZV8 630 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 FAM47DPA6NHR8 397 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CCDC159P0C7I6 412 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CDC42EP1Q00587 391 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CCT8L2Q96SF2 557 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ZNF185O15231 689 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 BLVRAP53004 296 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 PLD3Q8IV08 490 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ADSSL1Q8N142 457 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 NEU2Q9Y3R4 380 aa22.1■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 GOLGA8RI6L899 631 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 AKAP10O43572 662 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 TRIM51Q9BSJ1 452 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 FAM196BA6NMK8 535 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 WDR47O94967 919 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 RANBP1P43487 201 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 DPYDQ12882 1025 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MED15Q96RN5 788 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CDYLQ9Y232 598 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 PRR36Q9H6K5 1346 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 LAMC1P11047 1609 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MAP3K7CLP57077 242 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 LONRF1Q17RB8 773 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SRLQ86TD4 932 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SELENONQ9NZV5 590 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MYL2P10916 166 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 S100A5P33763 92 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MDH1BQ5I0G3 518 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 KIAA2013Q8IYS2 634 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ZFYVE19Q96K21 471 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 PALMDQ9NP74 551 aa22.09■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 SYTL3Q4VX76 610 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ABHD8Q96I13 439 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 MS4A14Q96JA4 679 aa22.08■■□□□ 1.13
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RNF40-201ENST00000324685 GALCP54803 685 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 RBP5P82980 135 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ADRA2BP18089 450 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 WASHC5Q12768 1159 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ATPAF2Q8N5M1 289 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 APPL2Q8NEU8 664 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 DPF2Q92785 391 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 PHF20Q9BVI0 1012 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 ZNF556Q9HAH1 456 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 KLHL11Q9NVR0 708 aa22.08■■□□□ 1.13
RNF40-201ENST00000324685 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 FMO5P49326 533 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 GTF2H3Q13889 308 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 PKN3Q6P5Z2 889 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 ZNF711Q9Y462 761 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 RHOBTB3O94955 611 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 CCND1P24385 295 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 NAB2Q15742 525 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 LDHDQ86WU2 507 aa22.08■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 GRIK1P39086 918 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 USP10Q14694 798 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 RNF149Q8NC42 400 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 PTPRN2Q92932 1015 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 DGAT1O75907 488 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 CYBBP04839 570 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 A0A1W2PQJ5 194 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 TBX3O15119 743 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 ARIH2O95376 493 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 KLC1Q07866 573 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 SPP2Q13103 211 aa22.07■■□□□ 1.12
RNF40-201ENST00000324685 CLEC4FQ8N1N0 589 aa22.07■■□□□ 1.12
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