RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 SPATA1Q5VX52 437 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.85□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 TRIM49CP0CI26 452 aa9.84□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 TSG101Q99816 390 aa9.84□□□□□ -0.83
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PDE4D-201ENST00000309641 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
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PDE4D-201ENST00000309641 TIGD5Q53EQ6 642 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
PDE4D-201ENST00000309641 WDR49Q8IV35 697 aa9.83□□□□□ -0.84
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