RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAM2Q99965 735 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 AIPL1Q9NZN9 384 aa22.33■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SOWAHDA6NJG2 315 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MGEA5O60502 916 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 STAT1P42224 750 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MFAP3P55082 362 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NOP14P78316 857 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GCNT1Q02742 428 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.32■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 A0A0U1RQF3 1178 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF623O75123 536 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ASS1P00966 412 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SKIP12755 728 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGA4P13612 1032 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 XKR4Q5GH76 650 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NECAB2Q7Z6G3 386 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 HELQQ8TDG4 1101 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KLK14Q9P0G3 267 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGA11Q9UKX5 1188 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT19P08727 400 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNE1P15382 129 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNJ6P48051 423 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL6P60660 151 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ASIC2Q16515 512 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CHP1Q99653 195 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 FTHL17Q9BXU8 183 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CXCL16Q9H2A7 254 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 DPP3Q9NY33 737 aa22.31■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ESPNB1AK53 854 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NBNO60934 754 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PARNO95453 639 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ITGB3P05106 788 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SOX5P35711 763 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GLRA4Q5JXX5 417 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SPOPLQ6IQ16 392 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TATDN2Q93075 761 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GPR88Q9GZN0 384 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 UBQLN1Q9UMX0 589 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 UMODL1Q5DID0 1318 aa22.3■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 XPOTO43592 962 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 FERP16591 822 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID5AQ03989 594 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB6Q15916 424 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF699Q32M78 642 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MRPL10Q7Z7H8 261 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 BEST2Q8NFU1 509 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TAF4BQ92750 862 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KAT5Q92993 513 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ELMO3Q96BJ8 720 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KREMEN1Q96MU8 473 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS18Q9NS28 235 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SIX4Q9UIU6 781 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SERPING1P05155 500 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC172P0C7W6 258 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 HGSNATQ68CP4 663 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GPIHBP1Q8IV16 184 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PGBD4Q96DM1 585 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 TBX21Q9UL17 535 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GIT1Q9Y2X7 761 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NUB1Q9Y5A7 615 aa22.29■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GFPT2O94808 682 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CLTBP09497 229 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 ATICP31939 592 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 KLHL30Q0D2K2 578 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MTF1Q14872 753 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SCARA3Q6AZY7 606 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RAD9BQ6WBX8 426 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CXorf38Q8TB03 319 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 SHC3Q92529 594 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RPS6KC1Q96S38 1066 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 XYLT2Q9H1B5 865 aa22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MEIS3P2A8K0S8 358 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 MLH1P40692 756 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GUCY2FP51841 1108 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 RBP5P82980 135 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 CUL2Q13617 745 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 GPNMBQ14956 572 aa22.27■■□□□ 1.16
PACSIN3-201ENST00000298838 AGMOQ6ZNB7 445 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms