RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 ALS2CLQ60I27 953 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF410Q86VK4 478 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 FMNL3Q8IVF7 1028 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 SAAL1Q96ER3 474 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC114Q96M63 670 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 HAPLN2Q9GZV7 340 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 STYXL1Q9Y6J8 313 aa21.83■■□□□ 1.09
UBE2B-201ENST00000265339 MACROD2A1Z1Q3 448 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8IPA6NC78 632 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA8JA6NMD2 632 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CABYRO75952 493 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 SEC24CP53992 1094 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 RDH13Q8NBN7 331 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 NDST4Q9H3R1 872 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 B4GALT5O43286 388 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GARTP22102 1010 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZPBP2Q6X784 338 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 KIRREL3Q8IZU9 778 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZIM3Q96PE6 472 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ACKR2O00590 384 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CCL5P13501 91 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 APBA1Q02410 837 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ITGA7Q13683 1181 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 VTI1AQ96AJ9 217 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CCT8L2Q96SF2 557 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 TTYH3Q9C0H2 523 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CDHR5Q9HBB8 845 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GINS2Q9Y248 185 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 LBX1P52954 281 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 EPHB4P54760 987 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 E2F5Q15329 346 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PARP9Q8IXQ6 854 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ARRDC4Q8NCT1 418 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 DEFB118Q96PH6 123 aa21.81■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PQY0 241 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 EZRP15311 586 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 AMHR2Q16671 573 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 TAF2Q6P1X5 1199 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 NLRP14Q86W24 1093 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CBWD2Q8IUF1 395 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 RNF217Q8TC41 542 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GLT1D1Q96MS3 346 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 RNF208Q9H0X6 261 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1B0GUA9 196 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ADRB2P07550 413 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PTGISQ16647 500 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 FAM187BQ17R55 369 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 WNT8BQ93098 351 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 SLC35C1Q96A29 364 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 FBXL18Q96ME1 805 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 OSMRQ99650 979 aa21.8■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CDC42EP1Q00587 391 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 BIRC2Q13490 618 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 SLFN12LQ6IEE8 588 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 KDM7AQ6ZMT4 941 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 SERINC5Q86VE9 423 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 A0A0B4J269 797 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ABLIM1O14639 778 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 TOM1L1O75674 476 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZBED6P86452 979 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CYB5D1Q6P9G0 228 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GPD1LQ8N335 351 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 MMGT1Q8N4V1 131 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC155Q8N6L0 562 aa21.79■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 ATF7IP2Q5U623 682 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 TCERG1LQ5VWI1 586 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 EMBQ6PCB8 327 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CCDC121Q6ZUS5 278 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 NME8Q8N427 588 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 PHF24Q9UPV7 400 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 KBTBD13C9JR72 458 aa21.78■■□□□ 1.08
UBE2B-201ENST00000265339 MAPK13O15264 365 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms