RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCL10P02778 98 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 IER5Q5VY09 327 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RHPN2Q8IUC4 686 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NME8Q8N427 588 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf20Q8ND61 904 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTS10Q9H324 1103 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TRPV2Q9Y5S1 764 aa28.3■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 BUB1O43683 1085 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TMOD1P28289 359 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GUCY2DQ02846 1103 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CUL1Q13616 776 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 FBXO47Q5MNV8 452 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF4BQ92750 862 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PBKQ96KB5 322 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB7Q99436 277 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NFU1Q9UMS0 254 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DNM3Q9UQ16 869 aa28.29■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL4O94818 638 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MYBP10242 640 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 MUTP22033 750 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CARSP49589 748 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PADI6Q6TGC4 694 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM59LQ9UK28 342 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RFC5P40937 340 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GPC3P51654 580 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 COASYQ13057 564 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM26FQ5R3K3 315 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 TRIM59Q8IWR1 403 aa28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGEF35A5YM69 484 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF233A6NK53 670 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD65E5RJM6 399 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DGAT1O75907 488 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 FGBP02675 491 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CD52P31358 61 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 USP38Q8NB14 1042 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC19Q96DA6 116 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 RUSC1Q9BVN2 902 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 STK24Q9Y6E0 443 aa28.27■■■□□ 2.12
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA6L10A6NI86 522 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 EYA4O95677 639 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NR1D1P20393 614 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LSP1P33241 339 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RFC2P35250 354 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TDHQ8IZJ6 230 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MS4A14Q96JA4 679 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ISCUQ9H1K1 167 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PLCB1Q9NQ66 1216 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PANK4Q9NVE7 773 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 EHD2Q9NZN4 543 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WZ62 844 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FSBPO95073 299 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FGFR4P22455 802 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CNPY4Q8N129 248 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC45Q96CN5 670 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP4Q96MN2 994 aa28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 M0QZ92 97 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R37O75864 691 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LIG3P49916 1009 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCLQ13371 301 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ASIC2Q16515 512 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 OTUD6BQ8N6M0 293 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 IFT81Q8WYA0 676 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRC4Q9NPP4 1024 aa28.25■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHL30Q0D2K2 578 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NLRP7Q8WX94 980 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PIK3R5Q8WYR1 880 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PPME1Q9Y570 386 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT14P02533 472 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RINT1Q6NUQ1 792 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTRT1Q8TDG2 376 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT12Q99456 494 aa28.24■■■□□ 2.11
CAPNS1-201ENST00000246533 HINFPQ9BQA5 517 aa28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.5 ms