RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ENPEPQ07075 957 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC15Q0P6D6 951 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MTFR1Q15390 333 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNG2Q16589 344 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 C15orf41Q9Y2V0 281 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 STRN3Q13033 797 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SV2AQ7L0J3 742 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SH2D3AQ9BRG2 576 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO28Q9NVF7 368 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SUFUQ9UMX1 484 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MYPNQ86TC9 1320 aa23.57■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ANP32DO95626 131 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCNB1P14635 433 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCND1P24385 295 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC8A3P57103 927 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 GHRHRQ02643 423 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 UGCGQ16739 394 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MAB21L3Q8N8X9 362 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC89Q8N998 374 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC77Q9BR77 488 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D22BQ9NU19 505 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PNMA3Q9UL41 463 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM150BA6NC51 233 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ICAM1P05362 532 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT16P08779 473 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RRM1P23921 792 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 USP37Q86T82 979 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF677Q86XU0 584 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RMDN2Q96LZ7 410 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PWWP2AQ96N64 755 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 L3MBTL1Q9Y468 752 aa23.56■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ABHD2P08910 425 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 KRT5P13647 590 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PTGER2P43116 358 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP24A1Q07973 514 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MGAT5Q09328 741 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NSMCE1Q8WV22 266 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKEF1Q9NU02 776 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 KLHL14Q9P2G3 628 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PROSCO94903 275 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TAC1P20366 129 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NPTX2P47972 431 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MYO1EQ12965 1108 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.55■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RALAP11233 206 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SLC39A4Q6P5W5 647 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC125Q86Z20 511 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKRD35Q8N283 1001 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MAML1Q92585 1016 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.361e-7■■■□□ 17.1
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HTATSF1-201ENST00000218364 PSTPIP1O43586 416 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 RPSAP08865 295 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PSMC5P62195 406 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.54■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MSH2P43246 934 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MTMR1Q13613 665 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 IZUMO3Q5VZ72 239 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CEP128Q6ZU80 1094 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF365Q70YC5 407 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 STK32BQ9NY57 414 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TBK1Q9UHD2 729 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 TCP10L2B9ZVM9 353 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CALCAP01258 141 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 KLRC2P26717 231 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 FOXN2P32314 431 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 CAP2P40123 477 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 LARGE2Q8N3Y3 721 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 KIF2BQ8N4N8 673 aa23.53■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 DENND3A2RUS2 1198 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 NFIBO00712 420 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 MAGEB2O15479 319 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 AOC3Q16853 763 aa23.52■■□□□ 1.36
HTATSF1-201ENST00000218364 XKR9Q5GH70 373 aa23.52■■□□□ 1.36
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